| 查看: 1521 | 回复: 3 | |||
cuicui2397新虫 (小有名气)
|
[求助]
vasp中，结构参数优化时，出现错误，求助！谢谢！
|
|
侯老师的vasp教程中，针对复杂情况的结构参数优化出现问题，求助！ 复杂的情况,以六角结构Mg的晶格常数为例 1.先进行一次体积保持不变的粒子驰豫的计算（ISIF=5） 2再把优化得到的CONTCAR拷贝成POSCAR，进行一次静态的计算 3对a的值取10个左右的点，每个点重复上面两步，得到静态计算下volume-Etot的关系。 这三部的脚步可以通过以下脚本run_cell来进行，内容如下： #!/bin/sh rm WAVECAR for i in 5.20 5.23 5.26 5.29 5.32 5.35 5.38 5.41 5.44 5.47 do cat > POSCAR << ! ureadopef $i 0 -1 0 0.8660254 0.5 0 0 0 1.6230530 2 Direct 0.666666667 0.333333333 0.75 0.333333333 0.666666667 0.25 ! cp INCAR.relax INCAR echo "a=$i angestrom"; mpiexec -np 8 vasp cp CONTCAR POSCAR cp INCAR.static INCAR echo "a= $i angstrom ";mpiexec -np 8 vasp E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n", $5}'` V=`grep "volume" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.4f \n", $5}'` echo $V $E >>EtVo.dat done 4.采用状态方程拟合得到的平衡态下的体积，体弹性模量。 5.在该体积下，重复上面第2步和第3步，得到平衡状态下的其他晶胞参数。这一步也就是：在的到了E(V)曲线后，通过状态方程拟合得到平衡状态下的体积，计算出上面脚本中的变量$i的值，并改变$i的循环值，再运行run_cell计算一次，得到其他的结构参数c和位置u。 我的问题是：在执行sh run.cell命令时，出现错误提示是这样的： run_cell: line 15: syntax error near unexpected token `newline' run_cell: line 15: `!' 请问这是什么错误啊？谢谢！我改了改！附近的内容，还是不行。 |
回复此楼» 猜你喜欢
大佬帮着分析今年的评审意见？该课题连续申请了三年了，明年要不要换个方向。
已经有10人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有6人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有6人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有6人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有6人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有8人回复
-
两块石头
已经有9人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- vasp结构优化出现问题：算完一个离子步后就停止
已经有12人回复
- vasp表面和吸附分子的结构分别优化后，如何将它们放到一起
已经有11人回复
- VASP结构优化后，最下面一层固定的原子也移动了，怎么回事？
已经有8人回复
- 用VASP优化结构收敛不了，求指教
已经有10人回复
- vasp结构优化中EDIFF以及KPOINTS设置，以及氢吸附结合能问题！
已经有17人回复
- VASP结构优化时出现的POTIM问题
已经有4人回复
- VASP优化不成功，找不到原因
已经有8人回复
- 求助：vasp结构优化不能收敛
已经有18人回复
- vasp进行固定某些原子的某些坐标的结构优化
已经有5人回复
- vasp中优化晶体，如何固定一个角度
已经有6人回复
- vasp优化结构中出现的问题
已经有10人回复
- VASP并行可执行软件包，可对晶胞参数进行部分优化
已经有17人回复
- VASP优化结构遇到的问题。
已经有9人回复
- 【活动or资源】vasp晶体结构优化
已经有142人回复
- 【求助】vasp 高压相结构优化
已经有17人回复
- 【求助】结构优化中，如何选择POTIM？
已经有7人回复
- 【求助】VASP怎么做晶格参数的结构优化
已经有17人回复
- 【求助】vasp优化晶格参数a
已经有13人回复
- 【求助】简单问题----关于vasp晶格优化
已经有7人回复
- 【求助】vasp中如何做结构优化？
已经有10人回复
- 【求助】vasp优化团簇出错 求Pd的INCAR文件
已经有21人回复
- 【求助成功】VASP中，如何固定磁矩做结构优化
已经有14人回复
- 【求助】vasp结构优化时，LORBIT=11没有注释掉有无影响？
已经有4人回复
- 【求助】Vasp优化
已经有13人回复
- 【讨论】vasp结构优化之前的测试
已经有11人回复
cuicui2397
新虫 (小有名气)
- 应助: 5 (幼儿园)
- 金币: 1611.8
- 红花: 2
- 帖子: 211
- 在线: 130.4小时
- 虫号: 2198831
- 注册: 2012-12-21
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
2楼2013-11-15 20:57:12
3楼2016-08-30 19:22:02
相丽温
新虫 (著名写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 8830.6
- 红花: 1
- 帖子: 1048
- 在线: 144.8小时
- 虫号: 3400328
- 注册: 2014-09-05
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
4楼2016-10-31 18:42:00
100