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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 用autodock对接，用什么软件定点突变蛋白质
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s1g2k3

铁虫 (小有名气)

[求助] 用autodock对接，用什么软件定点突变蛋白质 已有2人参与

我用sybyl定点突变然后做了分子动力学，但是转到autodock上做对接准备时设置柔性残基就出现错误，由于sybyl用的不是太熟练，如果有新的定点突变的方法或者解决sybyl的问题都可以～谢谢各位。
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知识总是多的学不完，但是真的艺不压身。
1楼 2013-10-10 16:35:17
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longytu

捐助贵宾 (正式写手)

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★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-12-05 20:58:47
引用回帖:
5楼: Originally posted by wl507586 at 2013-10-13 12:42:08
这个怎么搞呢......

如果是晶体结构，而且点残基突变而不是很多残基的突变，不会影响太大的变化，故感觉不做动力学优化也可
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7楼2013-10-21 08:26:03
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longytu

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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s1g2k3: 金币+1, ★有帮助, 没有做分子动力学只改这个也没用 2013-10-20 16:18:31
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-12-05 20:59:06
用pymol可以实现点突变
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2楼2013-10-11 19:21:36
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rantingjing

铜虫 (小有名气)

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★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-12-09 18:22:01
discovery studio
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ll
3楼2013-10-13 08:59:57
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rantingjing

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-12-05 20:58:54
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-12-09 18:22:08
amber tleap tool can repair the protein residue automatically according to several force field parameters.
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ll
4楼2013-10-13 09:02:43
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