| 查看: 2071 | 回复: 10 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
关于未知菌的16s rDNA序列在ncbi上分析的结果很奇怪 已有1人参与
|
|||
|
做了差不多一个月的分子实验，小小本科生到现在都还没回家，班上女生就我一个没回去过了，各种想家啊。昨天上海那边终于把测序结果返过来，很奇怪，blast后发现貌似没有芽孢杆菌的类似菌做对比，相反都是没有芽孢的菌，（挑去培养一天的单菌落，做过芽孢染色，知道至少是芽孢杆菌），做实验的时候觉得可能自己无菌操作有问题，因为培养液浑浊沉淀根本不一样，有的有分层，有的是均匀的浑浊，各位大神也可以帮忙看下我发的另外一帖子（http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6209229），里面有关于无菌操作现象的详细描述。 然后我查了下给出的类似菌种，发现大多是杆菌，只是没芽孢，跟我镜检下的情况也类似，因为芽孢染色效果不理想，大多只能看到杆菌，而且培养时间16个小时，看不到大量芽孢，所以不确定是否染菌了，但是这个结果返回来之后，我就慌了，没一种是芽孢杆菌，是不是真的意味着我操作有问题啊，全错啊。还是我自己不会用blast，技术渣啊？我把序列附上了，希望大神帮我看下是不是真的不是芽孢杆菌。如果不是，我实验就全白搭了，时间也浪费了，钱也浪费了，好心疼，好想家啊。  cry: |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : ZB08110002(BACLILLUSSUBTIHIS)M13+_G02.seq
2013-08-15 20:10:00, 1.26 K
» 猜你喜欢
材料工程085601，270求调剂
已经有24人回复
-
085404 293求调剂
已经有3人回复
-
调剂
已经有21人回复
-
复试调剂，一志愿郑州大学材料与化工289分
已经有15人回复
-
08工科求调剂290分
已经有12人回复
-
286求调剂
已经有16人回复
-
材料类284调剂
已经有24人回复
-
考研调剂-材料类-284
已经有14人回复
-
327求调剂
已经有11人回复
-
一志愿985初试354分生物调剂
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 16S rRNA序列分析法和16rDNA分析的区别？
已经有7人回复
- 大家帮看看我做这个系统发育树是否可用，做法是否正确，谢谢了~~
已经有16人回复
- 如何从NCBI上下载菌株的16S rDNA序列，请问在NCBI上如何下载？
已经有5人回复
- 寻求把细菌的16s rDNA序列提交到Genbank，申请accession number 的专家-谢谢！
已经有3人回复
- 通用引物扩增细菌16S rDNA
已经有13人回复
- 菌株16S rDNA同源性分析方法！！
已经有5人回复
- 进化树分析求助
已经有6人回复
- 进化树分析求助
已经有5人回复
- 进化树绘制求助
已经有9人回复
- 【求助/交流】16s rDNA,在NCBI blast
已经有3人回复
- 【求助/交流】怎么在ncbi上查询细菌的16s rDNA的全序列？
已经有3人回复
- 【求助/交流】标准菌株16s序列怎么在ncbi中查询
已经有9人回复
eagles123
金虫 (正式写手)
- MicEPI: 1
- 应助: 154 (高中生)
- 金币: 5854.4
- 散金: 1607
- 红花: 12
- 帖子: 667
- 在线: 700.7小时
- 虫号: 322286
- 注册: 2007-03-11
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
7楼2013-08-15 21:43:07
eagles123
金虫 (正式写手)
- MicEPI: 1
- 应助: 154 (高中生)
- 金币: 5854.4
- 散金: 1607
- 红花: 12
- 帖子: 667
- 在线: 700.7小时
- 虫号: 322286
- 注册: 2007-03-11
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
2楼2013-08-15 21:28:45
3楼2013-08-15 21:36:11
4楼2013-08-15 21:38:58
100