24小时热门版块排行榜    

查看: 2002  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

放肆猫某人

铜虫 (小有名气)

[交流] 关于未知菌的16s rDNA序列在ncbi上分析的结果很奇怪 已有1人参与

做了差不多一个月的分子实验,小小本科生到现在都还没回家,班上女生就我一个没回去过了,各种想家啊。昨天上海那边终于把测序结果返过来,很奇怪,blast后发现貌似没有芽孢杆菌的类似菌做对比,相反都是没有芽孢的菌,(挑去培养一天的单菌落,做过芽孢染色,知道至少是芽孢杆菌),做实验的时候觉得可能自己无菌操作有问题,因为培养液浑浊沉淀根本不一样,有的有分层,有的是均匀的浑浊,各位大神也可以帮忙看下我发的另外一帖子(http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6209229),里面有关于无菌操作现象的详细描述。
然后我查了下给出的类似菌种,发现大多是杆菌,只是没芽孢,跟我镜检下的情况也类似,因为芽孢染色效果不理想,大多只能看到杆菌,而且培养时间16个小时,看不到大量芽孢,所以不确定是否染菌了,但是这个结果返回来之后,我就慌了,没一种是芽孢杆菌,是不是真的意味着我操作有问题啊,全错啊。还是我自己不会用blast,技术渣啊?我把序列附上了,希望大神帮我看下是不是真的不是芽孢杆菌。如果不是,我实验就全白搭了,时间也浪费了,钱也浪费了,好心疼,好想家啊。cry:
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : ZB08110002(BACLILLUSSUBTIHIS)M13+_G02.seq
  • 2013-08-15 20:10:00, 1.26 K

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

eagles123

金虫 (正式写手)

染没染菌 不好说 要看到具体的东西才知道
7楼2013-08-15 21:43:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

eagles123

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你这个序列可能是质量不好啊,检查下质量先。你P的16S? BLAST 出来 没合格的match。
2楼2013-08-15 21:28:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

放肆猫某人

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by eagles123 at 2013-08-15 21:28:45
你这个序列可能是质量不好啊,检查下质量先。你P的16S? BLAST 出来 没合格的match。

!!!那请问下我要如何检查质量呢?难道要重做吗~
3楼2013-08-15 21:36:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

放肆猫某人

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by eagles123 at 2013-08-15 21:28:45
你这个序列可能是质量不好啊,检查下质量先。你P的16S? BLAST 出来 没合格的match。

对了 我还想问下为什么只有1100+bp 不是应该有1500左右吗 我电泳条带都在1500bp附近~
4楼2013-08-15 21:38:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +8 一鸭鸭哟 2026-03-14 10/500 2026-03-17 15:07 by 一鸭鸭哟
[考研] 085600材料与化工 +4 安全上岸! 2026-03-16 4/200 2026-03-17 14:02 by 勇敢太监王公公
[考研] 304求调剂 +7 小熊joy 2026-03-14 7/350 2026-03-17 08:53 by 雾散后相遇lc
[考研] 机械专硕325,寻找调剂院校 +3 y9999 2026-03-15 5/250 2026-03-16 19:58 by y9999
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 一志愿华中师范071000,325求调剂 +6 RuitingC 2026-03-12 6/300 2026-03-16 14:50 by 可淡不可忘
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考研] 080500,材料学硕302分求调剂学校 +4 初识可乐 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:08 by peike
[考研] 中科大材料专硕319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-13 3/150 2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 复试调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 328求调剂 +3 5201314Lsy! 2026-03-13 6/300 2026-03-14 15:31 by hyswxzs
[考研] 【0703化学调剂】-一志愿华中师范大学-六级475 +5 Becho359 2026-03-11 5/250 2026-03-14 11:35 by 哦哦123
[考研] 0703,333分求调剂 一志愿郑州大学-物理化学 +3 李魔女斗篷 2026-03-11 3/150 2026-03-13 22:24 by JourneyLucky
[考研] 求调剂(材料与化工327) +4 爱吃香菜啦 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:11 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +9 咪咪空空 2026-03-12 9/450 2026-03-13 22:05 by 星空星月
[考研] 材料工程调剂 +4 咪咪空空 2026-03-11 4/200 2026-03-13 19:57 by JourneyLucky
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
[考研] 求b区学校调剂 +3 周56 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:20 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕350 求调剂 +4 王金科 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:02 by ruiyingmiao
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
信息提示
请填处理意见