24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2067  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

放肆猫某人

铜虫 (小有名气)

[交流] 关于未知菌的16s rDNA序列在ncbi上分析的结果很奇怪 已有1人参与

做了差不多一个月的分子实验,小小本科生到现在都还没回家,班上女生就我一个没回去过了,各种想家啊。昨天上海那边终于把测序结果返过来,很奇怪,blast后发现貌似没有芽孢杆菌的类似菌做对比,相反都是没有芽孢的菌,(挑去培养一天的单菌落,做过芽孢染色,知道至少是芽孢杆菌),做实验的时候觉得可能自己无菌操作有问题,因为培养液浑浊沉淀根本不一样,有的有分层,有的是均匀的浑浊,各位大神也可以帮忙看下我发的另外一帖子(http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6209229),里面有关于无菌操作现象的详细描述。
然后我查了下给出的类似菌种,发现大多是杆菌,只是没芽孢,跟我镜检下的情况也类似,因为芽孢染色效果不理想,大多只能看到杆菌,而且培养时间16个小时,看不到大量芽孢,所以不确定是否染菌了,但是这个结果返回来之后,我就慌了,没一种是芽孢杆菌,是不是真的意味着我操作有问题啊,全错啊。还是我自己不会用blast,技术渣啊?我把序列附上了,希望大神帮我看下是不是真的不是芽孢杆菌。如果不是,我实验就全白搭了,时间也浪费了,钱也浪费了,好心疼,好想家啊。cry:
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : ZB08110002(BACLILLUSSUBTIHIS)M13+_G02.seq
  • 2013-08-15 20:10:00, 1.26 K

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

放肆猫某人

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by eagles123 at 2013-08-15 21:28:45
你这个序列可能是质量不好啊,检查下质量先。你P的16S? BLAST 出来 没合格的match。

对了 我还想问下为什么只有1100+bp 不是应该有1500左右吗 我电泳条带都在1500bp附近~
4楼2013-08-15 21:38:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

eagles123

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你这个序列可能是质量不好啊,检查下质量先。你P的16S? BLAST 出来 没合格的match。
2楼2013-08-15 21:28:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

放肆猫某人

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by eagles123 at 2013-08-15 21:28:45
你这个序列可能是质量不好啊,检查下质量先。你P的16S? BLAST 出来 没合格的match。

!!!那请问下我要如何检查质量呢?难道要重做吗~
3楼2013-08-15 21:36:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

放肆猫某人

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by eagles123 at 2013-08-15 21:28:45
你这个序列可能是质量不好啊,检查下质量先。你P的16S? BLAST 出来 没合格的match。

额 还可不可以再多问一个问题呀 这跟染菌与否有关吗 谢谢啦~
5楼2013-08-15 21:41:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +13 熊二想上岸 2026-04-04 13/650 2026-04-08 10:33 by 不吃魚的貓
[考研] 298求调剂 +4 残荷新柳 2026-04-07 4/200 2026-04-07 23:02 by lbsjt
[考研] 259求调剂 +5 就爱吃土豆呀呀 2026-04-07 5/250 2026-04-07 22:40 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕(0856) 339分求调剂 +14 哈哈哈鹅哈哈哈 2026-04-05 14/700 2026-04-07 22:02 by lijunpoly
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +6 崔wj 2026-04-02 6/300 2026-04-07 18:45 by 求调剂zz
[考研] 277求调剂 数一104分 +9 瓶子PZ 2026-04-05 14/700 2026-04-07 17:52 by 蓝云思雨
[考研] 285求调剂 +16 哦呦呼o 2026-04-04 16/800 2026-04-07 12:31 by 1018329917
[考研] 材料调剂 +17 小刘同学吖吖 2026-04-06 18/900 2026-04-07 11:41 by 诗与自由
[考研] 复试调剂 +14 呼呼?~+123456 2026-04-05 14/700 2026-04-06 22:50 by chenzhimin
[考研] 材料调剂 +10 一样YWY 2026-04-06 10/500 2026-04-06 21:05 by lbsjt
[考研] 机械专硕274求调剂,不挑专业学校 +6 泛泛2333 2026-04-05 8/400 2026-04-06 18:06 by 泛泛2333
[考研] 专硕304找调剂,一线城市最好 +3 李lsl李 2026-04-05 3/150 2026-04-06 12:16 by ffffjjjj
[考研] 0703求调剂383分 +9 W55j 2026-04-03 9/450 2026-04-06 06:50 by houyaoxu
[考研] 348求调剂 +6 wukira 2026-04-04 6/300 2026-04-05 18:11 by 猪会飞
[考研] 298求调剂 +3 manman511 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:09 by kk112233
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +4 崔wj 2026-04-04 5/250 2026-04-05 14:06 by imissbao
[考研] 工科08专硕机械275求调剂 +3 AaAa7420 2026-04-02 3/150 2026-04-05 13:26 by jp9609
[考研] 311求调剂 +20 zchqwer 2026-04-01 22/1100 2026-04-03 22:09 by lglzsd
[考研] 化工求调剂 +11 荔香芝士椰奶 2026-04-03 11/550 2026-04-03 22:06 by 啵啵啵0119
[考研] 372分材料与化工(085600)一志愿湖南大学求调剂 +3 蓝笺片 2026-04-03 4/200 2026-04-03 17:58 by Jimmyandyou
信息提示
请填处理意见