24小时热门版块排行榜    

查看: 2000  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

放肆猫某人

铜虫 (小有名气)

[交流] 关于未知菌的16s rDNA序列在ncbi上分析的结果很奇怪 已有1人参与

做了差不多一个月的分子实验,小小本科生到现在都还没回家,班上女生就我一个没回去过了,各种想家啊。昨天上海那边终于把测序结果返过来,很奇怪,blast后发现貌似没有芽孢杆菌的类似菌做对比,相反都是没有芽孢的菌,(挑去培养一天的单菌落,做过芽孢染色,知道至少是芽孢杆菌),做实验的时候觉得可能自己无菌操作有问题,因为培养液浑浊沉淀根本不一样,有的有分层,有的是均匀的浑浊,各位大神也可以帮忙看下我发的另外一帖子(http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=6209229),里面有关于无菌操作现象的详细描述。
然后我查了下给出的类似菌种,发现大多是杆菌,只是没芽孢,跟我镜检下的情况也类似,因为芽孢染色效果不理想,大多只能看到杆菌,而且培养时间16个小时,看不到大量芽孢,所以不确定是否染菌了,但是这个结果返回来之后,我就慌了,没一种是芽孢杆菌,是不是真的意味着我操作有问题啊,全错啊。还是我自己不会用blast,技术渣啊?我把序列附上了,希望大神帮我看下是不是真的不是芽孢杆菌。如果不是,我实验就全白搭了,时间也浪费了,钱也浪费了,好心疼,好想家啊。cry:
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : ZB08110002(BACLILLUSSUBTIHIS)M13+_G02.seq
  • 2013-08-15 20:10:00, 1.26 K

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

放肆猫某人

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by eagles123 at 2013-08-15 21:28:45
你这个序列可能是质量不好啊,检查下质量先。你P的16S? BLAST 出来 没合格的match。

对了 我还想问下为什么只有1100+bp 不是应该有1500左右吗 我电泳条带都在1500bp附近~
4楼2013-08-15 21:38:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

eagles123

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你这个序列可能是质量不好啊,检查下质量先。你P的16S? BLAST 出来 没合格的match。
2楼2013-08-15 21:28:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

放肆猫某人

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by eagles123 at 2013-08-15 21:28:45
你这个序列可能是质量不好啊,检查下质量先。你P的16S? BLAST 出来 没合格的match。

!!!那请问下我要如何检查质量呢?难道要重做吗~
3楼2013-08-15 21:36:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

放肆猫某人

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by eagles123 at 2013-08-15 21:28:45
你这个序列可能是质量不好啊,检查下质量先。你P的16S? BLAST 出来 没合格的match。

额 还可不可以再多问一个问题呀 这跟染菌与否有关吗 谢谢啦~
5楼2013-08-15 21:41:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿苏州大学材料工程(085601)专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +5 大火山小火山 2026-03-16 7/350 2026-03-17 10:26 by peike
[考研] 材料专硕326求调剂 +5 墨煜姒莘 2026-03-15 5/250 2026-03-16 21:30 by 木瓜膏
[基金申请] 国自科面上基金字体 +6 iwuli 2026-03-12 7/350 2026-03-16 21:18 by sculhf
[考研] 304求调剂 +5 素年祭语 2026-03-15 5/250 2026-03-16 17:00 by 我的船我的海
[考研] 277材料科学与工程080500求调剂 +3 自由煎饼果子 2026-03-16 3/150 2026-03-16 14:10 by 运气yunqi
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 288求调剂 +4 奇点0314 2026-03-14 4/200 2026-03-14 23:04 by JourneyLucky
[考研] 289求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-14 6/300 2026-03-14 18:58 by userper
[考研] 材料080500调剂求收留 +3 一颗meteor 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:54 by peike
[考研] 308 085701 四六级已过求调剂 +7 温乔乔乔乔 2026-03-12 14/700 2026-03-14 10:49 by JourneyLucky
[考研] 0703化学调剂 +4 快乐的香蕉 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:41 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +5 是Lupa啊 2026-03-11 5/250 2026-03-13 22:13 by JourneyLucky
[考研] 四川大学085601材料工程专硕 初试294求调剂 +4 祝我们好在冬天 2026-03-11 4/200 2026-03-13 21:39 by peike
[考研] 310求调剂 +3 【上上签】 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:16 by JourneyLucky
[考研] 一志愿211化学学硕310分求调剂 +8 努力奋斗112 2026-03-12 9/450 2026-03-13 15:41 by JourneyLucky
[考研] 0856化工原理 +6 z2839474511 2026-03-10 6/300 2026-03-13 10:41 by houyaoxu
[考研] 08食品或轻工求调剂,本科发表3篇sci一区top论文,一志愿南师大食品科学与工程 +3 我是一个兵, 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:21 by Yuyi.
[考研] 420求调剂 +4 莫向外求11 2026-03-10 6/300 2026-03-12 14:41 by ruiyingmiao
[考研] 大连大学化学专业研究生调剂 +3 琪久. 2026-03-10 8/400 2026-03-11 10:02 by 琪久.
[基金申请] 提交后的基金本子,已让学校撤回了,可否换口子提交 +3 dut_pfx 2026-03-10 3/150 2026-03-11 08:38 by kudofaye
信息提示
请填处理意见