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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 核酸序列比对方法
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lvsihan

银虫 (正式写手)

[求助] 核酸序列比对方法

如果想要知道某一段基因序列的同源性的高低应该如何做？具体点哦，非常感谢……
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1楼2013-07-11 13:15:12
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lvsihan

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by figmeiling at 2013-07-12 07:37:04
你可以找到那个物种的近缘种，然后在NCBI上下载近缘种的该基因序列，现用CLUSTALX对该物种的基因和其他物种的同一个基因进行比对，构建树。

我是比照了几个，我到不用到构建树的一部，就是想知道这么序列的保守性如何。我好像没有判断的标准一样的感觉……
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6楼2013-07-12 10:30:43
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lkp282704124

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
137167741: 金币+1, 小木虫交流，共同进步~~ 2013-07-16 09:11:55
lvsihan(wizardfan代发): 金币+3, 谢谢参与 2013-07-18 05:32:24
进入NCBI中，进行Blast相似性搜索，下面就有同源基因。然后你做什么基因就用什么基因进行比对就可以了。
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假作真时真亦假，无为有处有还无。
2楼2013-07-11 13:40:28
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lvsihan

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lkp282704124 at 2013-07-11 13:40:28
进入NCBI中，进行Blast相似性搜索，下面就有同源基因。然后你做什么基因就用什么基因进行比对就可以了。

操作了一下，可行！非常感谢！
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3楼2013-07-11 14:00:19
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figmeiling

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
137167741: 金币+1, 小木虫交流，共同进步~~ 2013-07-16 09:12:04
lvsihan(wizardfan代发): 金币+2, 谢谢参与 2013-07-18 05:32:54
你可以找到那个物种的近缘种，然后在NCBI上下载近缘种的该基因序列，现用CLUSTALX对该物种的基因和其他物种的同一个基因进行比对，构建树。
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4楼2013-07-12 07:37:04
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