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lvsihan

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[求助] 核酸序列比对方法

如果想要知道某一段基因序列的同源性的高低应该如何做？具体点哦，非常感谢……

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1楼 2013-07-11 13:15:12

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lkp282704124

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感谢参与，应助指数 +1
137167741: 金币+1, 小木虫交流，共同进步~~ 2013-07-16 09:11:55
lvsihan(wizardfan代发): 金币+3, 谢谢参与 2013-07-18 05:32:24

进入NCBI中，进行Blast相似性搜索，下面就有同源基因。然后你做什么基因就用什么基因进行比对就可以了。

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假作真时真亦假，无为有处有还无。

2楼2013-07-11 13:40:28

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lvsihan

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2楼: Originally posted by lkp282704124 at 2013-07-11 13:40:28
进入NCBI中，进行Blast相似性搜索，下面就有同源基因。然后你做什么基因就用什么基因进行比对就可以了。

操作了一下，可行！非常感谢！

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3楼2013-07-11 14:00:19

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figmeiling

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137167741: 金币+1, 小木虫交流，共同进步~~ 2013-07-16 09:12:04
lvsihan(wizardfan代发): 金币+2, 谢谢参与 2013-07-18 05:32:54

你可以找到那个物种的近缘种，然后在NCBI上下载近缘种的该基因序列，现用CLUSTALX对该物种的基因和其他物种的同一个基因进行比对，构建树。

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4楼2013-07-12 07:37:04

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lkp282704124

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3楼: Originally posted by lvsihan at 2013-07-11 15:00:19
操作了一下，可行！非常感谢！...

不客气，我是来转金币+帮忙的！呵呵

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5楼2013-07-12 07:42:35

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4楼: Originally posted by figmeiling at 2013-07-12 07:37:04
你可以找到那个物种的近缘种，然后在NCBI上下载近缘种的该基因序列，现用CLUSTALX对该物种的基因和其他物种的同一个基因进行比对，构建树。

我是比照了几个，我到不用到构建树的一部，就是想知道这么序列的保守性如何。我好像没有判断的标准一样的感觉……

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6楼2013-07-12 10:30:43

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lvsihan

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5楼: Originally posted by lkp282704124 at 2013-07-12 07:42:35
不客气，我是来转金币+帮忙的！呵呵...

跟我比起来你都好多金币了，哎，我个初出茅庐的以后金币应该省着点用……

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7楼2013-07-12 10:32:50

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7楼: Originally posted by lvsihan at 2013-07-12 11:32:50
跟我比起来你都好多金币了，哎，我个初出茅庐的以后金币应该省着点用……...

不要吝啬，这东西本来就是用来花的！

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8楼2013-07-14 19:57:47

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8楼: Originally posted by lkp282704124 at 2013-07-14 19:57:47
不要吝啬，这东西本来就是用来花的！...

亲，前提是我得赚的够我花啊！！！

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9楼2013-07-16 09:04:21

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