应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 如何进行基因中外显子和内含子的分析
121/2返回列表12下一页
查看: 4971  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

guxinkoo

新虫 (小有名气)

[求助] 如何进行基因中外显子和内含子的分析

本人想做人β-酪蛋白全基因测序，但是不知道如何判断哪段是外显子，哪段是内含子，菜鸟一枚，问题有点白，请各位高手教教小弟，谢谢！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

生物信息学

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-06-22 08:32:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

凌波丽

专家顾问 (知名作家)
内容已删除
赞一下(1人) 回复此楼
11楼2014-07-09 10:35:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

137167741

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, Gifts of roses, hand there are lingering fragrance. Look forward to your wonderful and more detailed answer. 2013-06-22 16:53:13
第一、序列是否已知
第二、mRNA是否已知
第三、cds是否已知
第四、其他相近物种相关信息是否已知
第五、序列比对
赞一下 回复此楼
总有一天我要修改用户名。
2楼2013-06-22 09:26:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

robustli

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, Gifts of roses, hand there are lingering fragrance. Look forward to your wonderful and more detailed answer. 2013-06-22 16:53:21
如果知道基因组序列可以用genescan先预测一下外显子部分，剩下的就应该是内含子了
赞一下 回复此楼
immunologyparasite
3楼2013-06-22 11:16:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dcb005

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, Gifts of roses, hand there are lingering fragrance. Look forward to your wonderful and more detailed answer. 2013-06-22 16:53:29
guxinkoo: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-06-27 16:07:06
很简单啊，分别用cDNA和genomic DNA 做模板，之后送去测序，cDNA 不包含的序列不就是内含子
赞一下 回复此楼
★穷则独善其身,达则兼济天下★
4楼2013-06-22 11:54:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guxinkoo

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 137167741 at 2013-06-22 09:26:25
第一、序列是否已知
第二、mRNA是否已知
第三、cds是否已知
第四、其他相近物种相关信息是否已知
第五、序列比对

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... amp;amp;strand=true
这是我在ncbi上查到的相关信息，请问根据里面的序列，直接设计引物进行PCR可以吗？是否还需要再查一些其它信息呢？
赞一下 回复此楼
5楼2013-06-22 12:41:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guxinkoo

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by dcb005 at 2013-06-22 11:54:30
很简单啊，分别用cDNA和genomic DNA 做模板，之后送去测序，cDNA 不包含的序列不就是内含子

首先谢谢您的回复！
我刚接触这方面，不太懂您说的分别用cDNA 和genomic DNA为模版的意思，您方便说的详细些吗？是用这两个DNA为模板，用引物进行PCR然后测序吗？但是这个引物我也能更改怎么选呢？
赞一下 回复此楼
6楼2013-06-22 12:45:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guxinkoo

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by robustli at 2013-06-22 11:16:03
如果知道基因组序列可以用genescan先预测一下外显子部分，剩下的就应该是内含子了

谢谢您的回复！
您说的genescan软件，您有吗，可以发给我吗？谢谢，
邮箱  guxinkoo@163.com
赞一下 回复此楼
7楼2013-06-22 12:48:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dcb005

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by guxinkoo at 2013-06-22 12:45:30
首先谢谢您的回复！
我刚接触这方面，不太懂您说的分别用cDNA 和genomic DNA为模版的意思，您方便说的详细些吗？是用这两个DNA为模板，用引物进行PCR然后测序吗？但是这个引物我也能更改怎么选呢？...

是的，不同模板做PCR测序
赞一下 回复此楼
★穷则独善其身,达则兼济天下★
8楼2013-06-23 13:01:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

robustli

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

genescan is a open website. Go to this link http://genes.mit.edu/GENSCAN.html
赞一下 回复此楼
immunologyparasite
9楼2013-06-24 22:05:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

武穆大成

木虫 (著名写手)

笨蛋

【答案】应助回帖

http://biotf.cn/,这个网站上有很多这方面的东东，希望有帮助
赞一下 回复此楼
10楼2013-06-25 09:25:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 guxinkoo 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0703化学调剂 ，六级已过，有科研经历 +4 曦熙兮 2026-03-15 4/200 2026-03-15 18:01 by JourneyLucky
[考研] 267一志愿南京工业大学0817化工求调剂 +5 SUICHILD 2026-03-12 5/250 2026-03-14 14:53 by jean5056
[考研] 【0703化学调剂】-一志愿华中师范大学-六级475 +5 Becho359 2026-03-11 5/250 2026-03-14 11:35 by 哦哦123
[考研] 求调剂，药学 +3 归零lbm 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:21 by JourneyLucky
[考研] 2026考研调剂+本科延边大学+山东大学+生物化学与分子生物学+有项目经验 +3 ccdsscjy 2026-03-09 6/300 2026-03-14 02:14 by JourneyLucky
[考研] 求调剂！ +4 朔朔话 2026-03-09 4/200 2026-03-14 01:38 by JourneyLucky
[考研] 环境调剂 +6 晓看天暮看云 2026-03-09 6/300 2026-03-14 01:16 by JourneyLucky
[考研] 265求调剂 +9 小木虫085600 2026-03-09 12/600 2026-03-14 01:11 by JourneyLucky
[考研] 271求调剂 +10 生如夏花… 2026-03-11 10/500 2026-03-14 00:35 by 卖报员小雨
[考研] ［0860］321分求调剂，ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 285化工学硕求调剂（081700） +6 柴郡猫_ 2026-03-12 6/300 2026-03-13 20:46 by hmn_wj
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
[考研] 考研调剂 +4 芬达46 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:04 by ruiyingmiao
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
[考研] 285求调剂 +4 ytter 2026-03-12 4/200 2026-03-13 14:48 by jxchenghu
[论文投稿] 投稿问题 5+4 星光灿烂xt 2026-03-12 6/300 2026-03-13 14:17 by god_tian
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +3 d如愿上岸 2026-03-12 5/250 2026-03-13 10:56 by houyaoxu
[考研] 一志愿江南大学085701环境工程专硕总分287求调剂 +5 18266118446 2026-03-09 5/250 2026-03-11 16:51 by 2020015
[考研] 290求调剂 +3 柯淮然 2026-03-10 8/400 2026-03-11 13:48 by 柯淮然
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭