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关于提交ITS序列到genbank
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通过bankit把序列提交了 然后收到回信 要求增加信息 其中有一条是让说明序列的详细信息 但是我不清楚 做这个ITS也单纯是为了鉴定菌株 这个需要怎么回复呀？ 以下是回信摘录 [4] Complete feature annotation has not been included for some or all of the sequence(s) you have submitted. A. Please resubmit your sequence(s) with relevant features such as: - coding regions (CDS features), partial or complete, including nucleotide spans and reading frame. Using this information, our software will add the amino acid translations for you. - structural RNAs such as rRNAs, tRNAs, misc_RNAs, with nucleotide spans - features which may describe your sequence, such as repeat_regions, UTRs, promoters with nucleotide spans We have appended instructions for adding features to records. We cannot accept annotation in text format, you must resubmit. If your annotated sequences have coding region features with internal stop codons or reading frameshifts, you will be asked to review and resubmit. Please be sure to analyze your data prior to resubmission. B. If you know the correct annotation, but are unsure how to add it, please contact GenBank Users Services at: info@ncbi.nlm.nih.gov and include this message with your request. C. If you are unable to determine the feature annotation, please provide a biological reason for the lack of annotation. [ Last edited by 毛桃就是我 on 2013-6-21 at 11:26 ] |
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2楼2013-09-13 10:43:29
3楼2013-09-16 15:20:44
snoopytbw
荣誉版主 (著名写手)
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- 虫号: 3361216
- 注册: 2014-08-11
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- 专业: 环境微生物学
- 管辖: 微生物
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你测序结果blast，是非编码区么，如果是核糖体的话就标记为rRNA就好了哇，好像要求按照格式重新编辑好fasta发邮件到指定邮箱的吧，你仔细看看要求 发自小木虫Android客户端 |
5楼2018-04-11 20:30:43
