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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 专业学科区 » 食品 » 粮油与蛋白 » 蛋白疏水基团暴露示意图的绘制
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pzlove

金虫 (正式写手)

[求助] 蛋白疏水基团暴露示意图的绘制 已有1人参与

请教下各位，我想绘制蛋白疏水基团暴露的大概示意图。由于我的蛋白是面筋蛋白，结构太复杂，只能绘制示意图。求助ing
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1楼 2013-04-28 22:14:41
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renzhiq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你扫描一下蛋白的氨基酸序列，可以得到蛋白内部分子的氨基酸有哪些，模拟出该蛋白分子的三维结构，用Pymol软件打开，再将你的疏水基团标示出来就可以了，整个蛋白分子用cartoon格式，你选中的氨基酸用sphere格式就可以了，很简单的。祝实验顺利！
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2楼2013-05-01 09:57:45
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海之翔1991

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by renzhiq at 2013-05-01 09:57:45
你扫描一下蛋白的氨基酸序列，可以得到蛋白内部分子的氨基酸有哪些，模拟出该蛋白分子的三维结构，用Pymol软件打开，再将你的疏水基团标示出来就可以了，整个蛋白分子用cartoon格式，你选中的氨基酸用sphere格式就可 ...

好牛的样子
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3楼2014-10-10 16:51:02
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答非所问

荣誉版主 (职业作家)

ET.....

优秀版主

【答案】应助回帖

你可以找一个分子展示软件（pymol、dock），随便在pdb上面下载一个，一个蛋白质，呈现表面结构，就可以示意了
赞一下 回复此楼
获取网盘密码请点击：http://emuch.net/bbs/box.php（复制之后，黏贴到浏览器地址栏）
4楼2014-10-11 08:54:48
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