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汕头大学海洋科学接受调剂
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工大新生

银虫 (正式写手)

[求助] 求助关于DNA的优化

请问NAMD可以应用在DNA的优化上吗?另外,gauss可以吗?
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NAMD

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fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-05-02 08:19:44
NAMD设计出来就是为了模拟生物大分子的,模拟DNA最合适不过了

用NAMD做DNA模拟的论文没有一千篇也有八百篇了吧。。。
3楼2013-04-23 23:34:09
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查看全部 12 个回答

zc311213

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-05-02 08:19:12
dna属于多聚体形式,大分子物质,我认为,以目前计算机的性能,不易计算模拟吧!
yes
2楼2013-04-23 20:40:51
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childsliu

捐助贵宾 (正式写手)

二当家的

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-05-02 08:19:53
用NAMD优化DNA是没有任何问题的,别的MD软件也是可以的。Gauss优化碱基是可以的。
下苦功,三个字,一个叫下,一个叫苦,一个叫功,一定要振作精神,下苦功。
4楼2013-04-24 09:15:34
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工大新生

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by fhh2626 at 2013-04-23 23:34:09
NAMD设计出来就是为了模拟生物大分子的,模拟DNA最合适不过了

用NAMD做DNA模拟的论文没有一千篇也有八百篇了吧。。。

有木有中文版的教程可以参考一下?
5楼2013-05-01 10:22:15
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