应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 求助关于DNA的优化
121/2返回列表12下一页
查看: 1377  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

工大新生

银虫 (正式写手)

[求助] 求助关于DNA的优化

请问NAMD可以应用在DNA的优化上吗？另外，gauss可以吗？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

NAMD

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-04-23 14:21:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zc311213

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-05-02 08:19:12
dna属于多聚体形式，大分子物质，我认为，以目前计算机的性能，不易计算模拟吧！
赞一下 回复此楼
yes
2楼2013-04-23 20:40:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-05-02 08:19:44
NAMD设计出来就是为了模拟生物大分子的，模拟DNA最合适不过了

用NAMD做DNA模拟的论文没有一千篇也有八百篇了吧。。。
赞一下 回复此楼
3楼2013-04-23 23:34:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

childsliu

捐助贵宾 (正式写手)

二当家的

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-05-02 08:19:53
用NAMD优化DNA是没有任何问题的，别的MD软件也是可以的。Gauss优化碱基是可以的。
赞一下 回复此楼
下苦功，三个字，一个叫下，一个叫苦，一个叫功，一定要振作精神，下苦功。
4楼2013-04-24 09:15:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

工大新生

银虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by fhh2626 at 2013-04-23 23:34:09
NAMD设计出来就是为了模拟生物大分子的，模拟DNA最合适不过了

用NAMD做DNA模拟的论文没有一千篇也有八百篇了吧。。。

有木有中文版的教程可以参考一下？
赞一下 回复此楼
5楼2013-05-01 10:22:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

工大新生

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by childsliu at 2013-04-24 09:15:34
用NAMD优化DNA是没有任何问题的，别的MD软件也是可以的。Gauss优化碱基是可以的。

高斯一优化就死机 NAMD那些英文的看着太头大了
赞一下 回复此楼
6楼2013-05-01 10:22:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
工大新生: 金币+50, ★★★很有帮助, 你有教程吗？可以发我一下吗？ 742752165@qq.com 2013-05-06 15:04:52
引用回帖:
5楼: Originally posted by 工大新生 at 2013-05-01 10:22:15
有木有中文版的教程可以参考一下？...

NAMD有一个中文版的教程的
赞一下 回复此楼
7楼2013-05-01 11:51:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 工大新生 at 2013-05-01 10:22:56
高斯一优化就死机 NAMD那些英文的看着太头大了...

发给你了，你看看收到没有
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

工大新生
8楼2013-05-07 00:28:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

工大新生

银虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by fhh2626 at 2013-05-07 00:28:14
发给你了，你看看收到没有...

不好意思，好像没有收到，可能QQ邮箱有点问题，你发 chenjun1990@sina.cn吧，麻烦你了
赞一下 回复此楼
9楼2013-05-08 16:26:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 工大新生 at 2013-05-08 16:26:29
不好意思，好像没有收到，可能QQ邮箱有点问题，你发 chenjun1990@sina.cn吧，麻烦你了...

这次收到了么？
回复此楼
10楼2013-05-08 23:48:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 工大新生 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化工学硕294分，求导师收留 +33 yzyzx 2026-04-12 37/1850 2026-04-17 23:00 by wunaiy88
[考研] 求调剂 +9 小聂爱学习 2026-04-16 11/550 2026-04-17 22:34 by chixmc
[考研] 一志愿华中农业071010，320求调剂 +17 困困困困坤坤 2026-04-14 19/950 2026-04-17 20:08 by 关一盏灯cd
[考研] 295分求调剂 +5 ?要上岸? 2026-04-17 5/250 2026-04-17 16:51 by fenglj492
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀，最好在一个月之内的，研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 5/250 2026-04-17 10:02 by bobvan
[考研] 294求调剂 +14 淡然654321 2026-04-15 14/700 2026-04-16 21:01 by lpl364211
[考研] 291求调剂 +11 关忆北. 2026-04-14 11/550 2026-04-16 15:18 by jiahl2024
[考研] 26药学专硕105500求调剂 +6 喽哈加油 2026-04-13 7/350 2026-04-16 14:31 by zhouxiaoyu
[基金申请] RY：中国产出的科学垃圾论文，绝对数量和比例都世界第一 +7 zju2000 2026-04-14 18/900 2026-04-16 11:36 by 欢乐颂叶蓁
[考研] 279学硕食品专业求调剂院校 20+7 孤独的狼爱吃羊 2026-04-12 29/1450 2026-04-16 09:00 by screening
[考研] 求调剂推荐 +8 小聂爱学习 2026-04-14 8/400 2026-04-16 07:22 by 学员JpLReM
[考研] 通信工程求调剂！！！ +6 zlb770521 2026-04-14 6/300 2026-04-15 20:00 by 学员JpLReM
[考研] 求调剂 +12 何气正 2026-04-13 13/650 2026-04-14 14:47 by zs92450
[考研] 食品与营养（0955）271求调剂 +15 升格阿达 2026-04-12 16/800 2026-04-14 13:18 by 浮若_安生
[考研] 2026硕士调剂_能动_河南农业大学 +4 河南农业大学-能 2026-04-12 4/200 2026-04-13 22:01 by bljnqdcc
[考研] B区0809 ，数一英一，290 求调剂 +3 泠潍1111 2026-04-12 4/200 2026-04-13 20:35 by 学员JpLReM
[考研] 302求调剂 +10 易！? 2026-04-13 10/500 2026-04-13 19:04 by lbsjt
[考研] 297工科，求调剂? +13 河南农业大学-能 2026-04-12 13/650 2026-04-13 14:12 by dingyanbo1
[考研] 339求调剂 +4 hanwudada 2026-04-12 4/200 2026-04-13 12:03 by 蓝云思雨
[考研] 调剂结束 +6 floriea 2026-04-12 8/400 2026-04-12 18:13 by zhouxiaoyu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭