24小时热门版块排行榜    

查看: 1259  |  回复: 11

工大新生

银虫 (正式写手)

[求助] 求助关于DNA的优化

请问NAMD可以应用在DNA的优化上吗?另外,gauss可以吗?
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

NAMD

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zc311213

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-05-02 08:19:12
dna属于多聚体形式,大分子物质,我认为,以目前计算机的性能,不易计算模拟吧!
yes
2楼2013-04-23 20:40:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-05-02 08:19:44
NAMD设计出来就是为了模拟生物大分子的,模拟DNA最合适不过了

用NAMD做DNA模拟的论文没有一千篇也有八百篇了吧。。。
3楼2013-04-23 23:34:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

childsliu

捐助贵宾 (正式写手)

二当家的

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-05-02 08:19:53
用NAMD优化DNA是没有任何问题的,别的MD软件也是可以的。Gauss优化碱基是可以的。
下苦功,三个字,一个叫下,一个叫苦,一个叫功,一定要振作精神,下苦功。
4楼2013-04-24 09:15:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

工大新生

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by fhh2626 at 2013-04-23 23:34:09
NAMD设计出来就是为了模拟生物大分子的,模拟DNA最合适不过了

用NAMD做DNA模拟的论文没有一千篇也有八百篇了吧。。。

有木有中文版的教程可以参考一下?
5楼2013-05-01 10:22:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

工大新生

银虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by childsliu at 2013-04-24 09:15:34
用NAMD优化DNA是没有任何问题的,别的MD软件也是可以的。Gauss优化碱基是可以的。

高斯一优化就死机 NAMD那些英文的看着太头大了
6楼2013-05-01 10:22:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
工大新生: 金币+50, ★★★很有帮助, 你有教程吗?可以发我一下吗? 742752165@qq.com 2013-05-06 15:04:52
引用回帖:
5楼: Originally posted by 工大新生 at 2013-05-01 10:22:15
有木有中文版的教程可以参考一下?...

NAMD有一个中文版的教程的
7楼2013-05-01 11:51:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 工大新生 at 2013-05-01 10:22:56
高斯一优化就死机 NAMD那些英文的看着太头大了...

发给你了,你看看收到没有

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

8楼2013-05-07 00:28:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

工大新生

银虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by fhh2626 at 2013-05-07 00:28:14
发给你了,你看看收到没有...

不好意思,好像没有收到,可能QQ邮箱有点问题,你发 chenjun1990@sina.cn吧,麻烦你了
9楼2013-05-08 16:26:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 工大新生 at 2013-05-08 16:26:29
不好意思,好像没有收到,可能QQ邮箱有点问题,你发 chenjun1990@sina.cn吧,麻烦你了...

这次收到了么?
10楼2013-05-08 23:48:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 工大新生 的主题更新
信息提示
请填处理意见