应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 求助关于DNA的优化
121/2返回列表12下一页
查看: 1394  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

工大新生

银虫 (正式写手)

[求助] 求助关于DNA的优化

请问NAMD可以应用在DNA的优化上吗？另外，gauss可以吗？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

NAMD

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-04-23 14:21:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zc311213

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-05-02 08:19:12
dna属于多聚体形式，大分子物质，我认为，以目前计算机的性能，不易计算模拟吧！
赞一下 回复此楼
yes
2楼2013-04-23 20:40:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-05-02 08:19:44
NAMD设计出来就是为了模拟生物大分子的，模拟DNA最合适不过了

用NAMD做DNA模拟的论文没有一千篇也有八百篇了吧。。。
赞一下 回复此楼
3楼2013-04-23 23:34:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

childsliu

捐助贵宾 (正式写手)

二当家的

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2013-05-02 08:19:53
用NAMD优化DNA是没有任何问题的，别的MD软件也是可以的。Gauss优化碱基是可以的。
赞一下 回复此楼
下苦功，三个字，一个叫下，一个叫苦，一个叫功，一定要振作精神，下苦功。
4楼2013-04-24 09:15:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

工大新生

银虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by fhh2626 at 2013-04-23 23:34:09
NAMD设计出来就是为了模拟生物大分子的，模拟DNA最合适不过了

用NAMD做DNA模拟的论文没有一千篇也有八百篇了吧。。。

有木有中文版的教程可以参考一下？
赞一下 回复此楼
5楼2013-05-01 10:22:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

工大新生

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by childsliu at 2013-04-24 09:15:34
用NAMD优化DNA是没有任何问题的，别的MD软件也是可以的。Gauss优化碱基是可以的。

高斯一优化就死机 NAMD那些英文的看着太头大了
赞一下 回复此楼
6楼2013-05-01 10:22:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
工大新生: 金币+50, ★★★很有帮助, 你有教程吗？可以发我一下吗？ 742752165@qq.com 2013-05-06 15:04:52
引用回帖:
5楼: Originally posted by 工大新生 at 2013-05-01 10:22:15
有木有中文版的教程可以参考一下？...

NAMD有一个中文版的教程的
赞一下 回复此楼
7楼2013-05-01 11:51:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 工大新生 at 2013-05-01 10:22:56
高斯一优化就死机 NAMD那些英文的看着太头大了...

发给你了，你看看收到没有
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

工大新生
8楼2013-05-07 00:28:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

工大新生

银虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by fhh2626 at 2013-05-07 00:28:14
发给你了，你看看收到没有...

不好意思，好像没有收到，可能QQ邮箱有点问题，你发 chenjun1990@sina.cn吧，麻烦你了
赞一下 回复此楼
9楼2013-05-08 16:26:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 工大新生 at 2013-05-08 16:26:29
不好意思，好像没有收到，可能QQ邮箱有点问题，你发 chenjun1990@sina.cn吧，麻烦你了...

这次收到了么？
回复此楼
10楼2013-05-08 23:48:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 工大新生 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 我在等一个没有答案的答案 +3 Love_MH 2026-05-17 3/150 2026-05-18 02:22 by 竹林孤影
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 ky2p12rrjj 2026-05-15 4/200 2026-05-17 19:47 by Equinoxhua
[教师之家] 上海大学实验技术岗位非升即走 +7 嘻嘻哈哈乐呵呵 2026-05-15 7/350 2026-05-17 16:58 by songwz
[考博] 2026博士还有哪些学校有名额 +6 小王求读研 2026-05-15 7/350 2026-05-17 16:54 by 知音湖畔
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 v9tggjlwd0 2026-05-15 4/200 2026-05-17 08:11 by 11n4dfd8yn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 v9tggjlwd0 2026-05-15 4/200 2026-05-17 08:06 by 11n4dfd8yn
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 7hlccowb3h 2026-05-15 4/200 2026-05-17 07:46 by 11n4dfd8yn
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 l7k6xnh0yc 2026-05-14 6/300 2026-05-17 07:31 by 11n4dfd8yn
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 l7k6xnh0yc 2026-05-14 8/400 2026-05-17 07:26 by 11n4dfd8yn
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k37jurhrau 2026-05-16 3/150 2026-05-17 01:25 by ue3ir18jc3
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ky2p12rrjj 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:57 by ue3ir18jc3
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ky2p12rrjj 2026-05-15 3/150 2026-05-17 00:45 by ue3ir18jc3
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 v9tggjlwd0 2026-05-15 5/250 2026-05-17 00:32 by xiangfeng
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 x0mp7owy2b 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:25 by ue3ir18jc3
[高分子] 本人最近太闲了，谁有问题可以提，每天会统一回复 +9 一切都是空工 2026-05-12 20/1000 2026-05-16 19:52 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 x0mp7owy2b 2026-05-15 4/200 2026-05-16 17:45 by j6b2pdz07o
[硕博家园] 考博自荐 +3 科研狗111 2026-05-13 4/200 2026-05-16 11:45 by 科研狗111
[文学芳草园] 风把牡丹吹跑了 +5 myrtle 2026-05-12 9/450 2026-05-15 15:27 by myrtle
[教师之家] 教学课件你会给同学吗 +8 硕士研究生吗 2026-05-13 8/400 2026-05-14 22:23 by 常规沥青
[考博] 材料类只有一篇综述能申博么 +4 乐逍遥谷 2026-05-13 4/200 2026-05-14 12:05 by zhyzzh
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭