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凌夏V艾

木虫 (著名写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1580.7
红花: 1
帖子: 1201
在线: 116.3小时
虫号: 1121850
注册: 2010-10-13
专业: 理论和计算化学

[求助] 高斯优化--部分固定

我现在在做一个插层体系总共105个原子，用B3LYP优化，A为上层，B为下层，要把C分子插到层间，可查不到层间距，所以我想固定B层，放开C分子，这个现在可以实现，关键是要把A层放开，在计算过程中寻找能量最低点以确定层间距，可是A层原子的相对位置不能变，就是说A层要作为一个整体在垂直于B层的方向上移动，但A层内部的键长键角都不改变。请问这样能实现吗？能的话，该如何编辑gjf文件？谢谢。

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1楼 2013-04-03 09:27:41

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医无止境

木虫 (正式写手)

应助: 7 (幼儿园)
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红花: 3
帖子: 725
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注册: 2007-05-18
性别: GG
专业: 波谱分析与成像分析

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
凌夏V艾: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢您的回答，正在尝试 2013-04-04 10:25:52

可以实现，把分子坐标保存成内坐标形式，把A层的键长键角二面角固定，再优化

2楼2013-04-03 14:10:31

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xyj880506

银虫 (小有名气)

应助: 12 (小学生)
金币: 388.3
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红花: 4
帖子: 144
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虫号: 1157296
注册: 2010-11-27
性别: GG
专业: 理论和计算化学

GaussView 里有个大"R“的图标，点开后然后点add，再选择原子，固定想要固定的

3楼2013-04-03 19:04:40

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