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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 从高斯激发态优化输出文件中提取原子坐标
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医无止境

木虫 (正式写手)

[求助] 从高斯激发态优化输出文件中提取原子坐标

想从高斯激发态优化的输出文件中提取出最终优化结果的坐标，，请问原子坐标在输出文件中的什么地方呢？基态输出文件搜索Standard Orientation，找最后一个就可以了，但是激发态没有，是不是Input Orientation？如果不是搜索什么能得到呢？
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1楼 2011-11-16 09:19:26
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hlma_ustc

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

医无止境(金币+5): 2011-11-16 11:16:06
Input Orientation 和 Standard Orientation 都有啊，就在Population analysis 的上面。仔细看看输出文件，从后往前看。
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2楼2011-11-16 10:50:52
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zmcommon

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

医无止境(金币+15): 谢谢 2011-11-16 11:16:43
简单的方法：可以用GaussView打开out，然后在存成gjf，就能得到最后的坐标了
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3楼2011-11-16 10:58:29
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医无止境

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hlma_ustc at 2011-11-16 10:50:52:
Input Orientation 和 Standard Orientation 都有啊，就在Population analysis 的上面。仔细看看输出文件，从后往前看。

真的没有。我用最后一个input
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4楼2011-11-16 11:16:27
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医无止境

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zmcommon at 2011-11-16 10:58:29:
简单的方法：可以用GaussView打开out，然后在存成gjf，就能得到最后的坐标了

我也是这样弄得，但是不能用script批量操作
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5楼2011-11-16 11:17:28
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hlma_ustc

金虫 (小有名气)
这就奇怪啦，那你就用Input Orientation，所谓的 Standard Orientation 是Gaussian 09 里采用了某种对称操作后的坐标。
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6楼2011-11-16 12:11:33
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医无止境

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hlma_ustc at 2011-11-16 12:11:33:
这就奇怪啦，那你就用Input Orientation，所谓的 Standard Orientation 是Gaussian 09 里采用了某种对称操作后的坐标。

我也是奇怪，但是最后converge后有输出一次input orientation，我用的这个坐标
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7楼2011-11-16 12:42:49
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zmcommon

木虫 (小有名气)
你把你的OUT贴出来  我们看看帮你确认
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8楼2011-11-17 09:06:25
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gkf高

木虫 (著名写手)

世界和平
用GVIEW哈  简单明了、
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天空不留下鸟的痕迹，但是我已飞过。
9楼2011-11-17 22:04:08
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苏格拉没有地

铁虫 (正式写手)
楼主，我想把输出文件的坐标提出出来，写成gjf 文件，可以分享一下您是如何写的脚本
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10楼2018-05-03 12:51:02
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