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高斯优化--部分固定
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凌夏V艾
木虫
(著名写手)
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(幼儿园)
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红花: 1
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虫号: 1121850
注册: 2010-10-13
专业: 理论和计算化学
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求助
]
高斯优化--部分固定
我现在在做一个插层体系总共105个原子,用B3LYP优化,A为上层,B为下层,要把C分子插到层间,可查不到层间距,所以我想固定B层,放开C分子,这个现在可以实现,关键是要把A层放开,在计算过程中寻找能量最低点以确定层间距,可是A层原子的相对位置不能变,就是说A层要作为一个整体在垂直于B层的方向上移动,但A层内部的键长键角都不改变。请问这样能实现吗?能的话,该如何编辑gjf文件?谢谢。
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1楼
2013-04-03 09:27:41
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xyj880506
银虫
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红花: 4
帖子: 144
在线: 530.4小时
虫号: 1157296
注册: 2010-11-27
性别: GG
专业: 理论和计算化学
GaussView 里有个大"R“的图标,点开后然后点add,再选择原子,固定想要固定的
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3楼
2013-04-03 19:04:40
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医无止境
木虫
(正式写手)
应助: 7
(幼儿园)
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散金: 199
红花: 3
帖子: 725
在线: 244.6小时
虫号: 375432
注册: 2007-05-18
性别: GG
专业: 波谱分析与成像分析
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
凌夏V艾: 金币+10,
★★★
很有帮助, 谢谢您的回答,正在尝试
2013-04-04 10:25:52
可以实现,把分子坐标保存成内坐标形式,把A层的键长键角二面角固定,再优化
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2楼
2013-04-03 14:10:31
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