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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 如何确定所测DNA序列是哪个物种的?
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finesand

铜虫 (小有名气)

[求助] 如何确定所测DNA序列是哪个物种的?

实验测得数条DNA序列，如何确定每一条序列属于哪个物种的呢？blast的最相似序列对应的物种就是了吗？要比较序列之间相似性吗？要建树吗？
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1楼 2013-03-28 22:41:58
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platanus

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-04-27 16:51:07
序列比对只能确定基因序列的相似性而不能确定序列是哪个物种吧，除非序列已经报道且比对的序列达到100%的相似，但是同属里面相近物种的也有序列完全相似的啊，所以不好确定！
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5楼2013-03-29 11:30:22
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留小保

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
finesand(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-04-27 16:50:43
ncbi 查询   或者直接blast
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人生若只如初见 何事秋风悲画扇
2楼2013-03-29 09:04:16
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白翠

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
finesand(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-04-27 16:50:53
gyesang: 回帖置顶 2013-04-27 16:50:55
比对最相近的不一定是同一个物种，还要看相似性有多高，一般100%就差不多是同一个物种了。但是若是相似率只有80-90%，还要看你所比对的序列是那段基因上的，保守性如何。还可以将序列下载下来用DNAstar软件比对。
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Thedifferenceinwinningandlosingismostoften...notquitting
3楼2013-03-29 11:21:55
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白翠

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

前面软件名我给弄错了，应该是clustalw软件
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Thedifferenceinwinningandlosingismostoften...notquitting
4楼2013-03-29 11:25:13
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