应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 如何确定所测DNA序列是哪个物种的?
71/1返回列表
查看: 3424  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

finesand

铜虫 (小有名气)

[求助] 如何确定所测DNA序列是哪个物种的?

实验测得数条DNA序列，如何确定每一条序列属于哪个物种的呢？blast的最相似序列对应的物种就是了吗？要比较序列之间相似性吗？要建树吗？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-03-28 22:41:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

留小保

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
finesand(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-04-27 16:50:43
ncbi 查询   或者直接blast
赞一下 回复此楼
人生若只如初见 何事秋风悲画扇
2楼2013-03-29 09:04:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

白翠

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
finesand(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-04-27 16:50:53
gyesang: 回帖置顶 2013-04-27 16:50:55
比对最相近的不一定是同一个物种，还要看相似性有多高，一般100%就差不多是同一个物种了。但是若是相似率只有80-90%，还要看你所比对的序列是那段基因上的，保守性如何。还可以将序列下载下来用DNAstar软件比对。
赞一下 回复此楼
Thedifferenceinwinningandlosingismostoften...notquitting
3楼2013-03-29 11:21:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

白翠

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

前面软件名我给弄错了，应该是clustalw软件
赞一下 回复此楼
Thedifferenceinwinningandlosingismostoften...notquitting
4楼2013-03-29 11:25:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

platanus

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-04-27 16:51:07
序列比对只能确定基因序列的相似性而不能确定序列是哪个物种吧，除非序列已经报道且比对的序列达到100%的相似，但是同属里面相近物种的也有序列完全相似的啊，所以不好确定！
赞一下 回复此楼
5楼2013-03-29 11:30:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我爱吃木瓜啊
6楼2016-03-07 22:07:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sdjnyxn123

银虫 (小有名气)
看是什么生物的DNA了，一般来说微生物的话，差不多就跟相似度最高的那一个属于同一科同一属的了

动物的话，有些动物的部分基因直接在NCBI上找不到，我自己新克隆出的一个棘皮动物的基因比对之后相似度最高的是文昌鱼的对应基因，你说我这基因是不是文昌鱼的基因呢

植物不太清楚，按理说植物研究得比较深入了吧
赞一下 回复此楼
7楼2016-03-08 09:28:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 finesand 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 6/300 2026-11-06 09:03 by 2lRNluKrJpwL
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 9/450 2026-11-06 09:01 by 2lRNluKrJpwL
[基金申请] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 11/550 2026-11-06 05:43 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 10/500 2026-11-06 05:32 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 12/600 2026-11-06 05:32 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 05:21 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 05:21 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +7 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 11/550 2026-11-06 05:15 by Equinoxhua
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:11 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 13/650 2026-11-06 04:49 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +7 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 22/1100 2026-11-06 04:47 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 4/200 2026-11-06 02:37 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:15 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 10/500 2026-11-06 01:51 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:42 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 10/500 2026-11-06 01:40 by qL1cU46YIdK0
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-05 11:10 by PYZmcHr5kSaq
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭