应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » pdb文件修改
51/1返回列表
查看: 2030  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

spirte雷

木虫 (小有名气)

[求助] pdb文件修改

从RCSB下载下来的pdb 里面有小分子，可以自己删除掉吗，还有在文件里面的CONECT可以删除掉吗？会有什么影响
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

amber

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
用心体验就好
1楼 2013-03-26 12:12:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

d1023c

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
spirte雷: 金币+1, ★有帮助 2013-03-26 19:34:24
你可以把pdb改成mol2文件后，用sirius改
赞一下 回复此楼
5楼2013-03-26 17:44:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2013-03-26 14:56:03
spirte雷: 金币+4, ★★★很有帮助 2013-03-26 19:34:16
可以删掉的。。不会有什么影响
如果你用的是NAMD的话键连是靠PSF文件来说明的，PDB文件只是记录坐标位置而已
赞一下 回复此楼
2楼2013-03-26 13:07:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

spirte雷

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by fhh2626 at 2013-03-26 13:07:14
可以删掉的。。不会有什么影响
如果你用的是NAMD的话键连是靠PSF文件来说明的，PDB文件只是记录坐标位置而已

谢谢你，我用的是gromacs也一样没有影响吗？那要是gromacs的话键连是靠什么文件来说明的
赞一下 回复此楼
用心体验就好
3楼2013-03-26 15:56:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by spirte雷 at 2013-03-26 15:56:29
谢谢你，我用的是gromacs也一样没有影响吗？那要是gromacs的话键连是靠什么文件来说明的...

没有影响的，GROMACS和NAMD类似，也有拓扑文件，可能这个文件需要自己写
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

youngfi
4楼2013-03-26 16:43:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭