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guxiao1990

新虫 (初入文坛)

[求助] 转录组测序所需RNA提取

各位大神,我现在要做西兰花转录组测序,需要自己提RNA,要求质量很高,提的总是达不到要求,而且貌似杂质很多,有没有什么好的方法解决,或者好的试剂盒?谢谢了哈~
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grape_vine

金虫 (小有名气)

1, 我觉得用匀浆器对植物来说不合适,应该还是选择液氮研磨.
2, trizol提取拟南芥可以,但是西兰花是不是多糖比较多,所以你提取的杂质比较多.应该选择一个适合多糖多酚的试剂盒,国产的里面可以选择天择的植物多糖多酚RNA提取试剂盒,我们提葡萄效果还不错.
3,楼上的说的都很对,应该非常小心的,低温的操作.但是提取RNA更要防止内源的酶的降解,尤其是在研磨的过程当中,要防止温度回升(低温保护),在磨好以后加入裂解里面的时候要迅速和裂解液混合,使内源酶失活(蛋白变性剂保护),保护RNA。这也是为什么不建议用匀浆器,在你磨的过程中,细胞壁可能破碎的慢,但是细胞已经受损,裂解液又不能充分的进入破碎的细胞,使所有的酶失活,溶酶体里面可能就有酶出来降解RNA了。
11楼2013-07-03 17:08:45
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