应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求助各位高手：做SSR分子标记时，只知道上下游引物,请问如何知道所需目的片段的大小
101/1返回列表
查看: 2980  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

sweetian2011

铜虫 (初入文坛)

[求助] 求助各位高手：做SSR分子标记时，只知道上下游引物,请问如何知道所需目的片段的大小 已有1人参与

求助各位高手：我刚接触SSR，在做SSR分子标记时，跑得垂直电泳有的引物跑出来有四五条带，是否需要知道所需目的片段大小，才能选择自己所要的条带？如果需要知道目的片段大小该用什么方法呢？（引物是我师姐设计的，已经毕业，我只知道上下游引物序列，引物来源不清楚）
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
Where there's a will , there's a way!
1楼 2013-03-02 20:57:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

徐小培

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引物上有一段和DNA序列互补的，可以根据这个比对，估测出来！然后和电泳胶上指示的大小进行比对！
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

sweetian2011
2楼2013-03-02 22:09:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sweetian2011

铜虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 徐小培 at 2013-03-02 22:09:28
引物上有一段和DNA序列互补的，可以根据这个比对，估测出来！然后和电泳胶上指示的大小进行比对！

再请问一下，那个DNA序列应该在哪找，还是是在NCBI上直接blast,就知道比对结果
赞一下 回复此楼
Where there's a will , there's a way!
3楼2013-03-04 00:13:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

徐小培

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by sweetian2011 at 2013-03-04 00:13:00
再请问一下，那个DNA序列应该在哪找，还是是在NCBI上直接blast,就知道比对结果...

直接在word中搜索就行吧！你是这个意思吗？
赞一下 回复此楼
4楼2013-03-05 16:31:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sweetian2011

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 徐小培 at 2013-03-05 16:31:32
直接在word中搜索就行吧！你是这个意思吗？...

我的意思是，要与引物比对的DNA序列来源？
是必须找到引物来源，也就是已经发表的DNA序列，才能与引物进行比对吗？
赞一下 回复此楼
Where there's a will , there's a way!
5楼2013-03-05 16:44:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

徐小培

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by sweetian2011 at 2013-03-05 16:44:55
我的意思是，要与引物比对的DNA序列来源？
是必须找到引物来源，也就是已经发表的DNA序列，才能与引物进行比对吗？...

恩，应该文献中有，然后在NCBI找。比对就行！
赞一下 回复此楼
6楼2013-03-05 20:41:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sweetian2011

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 徐小培 at 2013-03-05 20:41:56
恩，应该文献中有，然后在NCBI找。比对就行！...

哦~ 谢谢
回复此楼
Where there's a will , there's a way!
7楼2013-03-07 18:10:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jishidong

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

在ncbi上用blast比对可以估计片段，大小。
非得要用这个引物的话可以提高退火温度，减少非特异条带
赞一下 回复此楼
8楼2013-05-29 22:53:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

檀指一挥

新虫 (初入文坛)
本帖内容被屏蔽
9楼2013-11-26 23:07:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fly_锋

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

楼上的方法都是可行的！你如果能找到引物合成公司，把你前端引物的标号发给他们，他们应该可以帮你查到你想要的！这个方法应该是最快的！
赞一下 回复此楼
10楼2014-10-21 11:13:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 sweetian2011 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 00:21 by mibUvS8DDCwf
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 00:12 by vZfe6xYu34yj
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 5/250 2026-09-14 23:57 by vZfe6xYu34yj
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 5/250 2026-09-14 23:33 by vZfe6xYu34yj
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:45 by vZfe6xYu34yj
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 6/300 2026-09-14 22:37 by vZfe6xYu34yj
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:25 by vZfe6xYu34yj
[找工作] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:13 by vZfe6xYu34yj
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:01 by vZfe6xYu34yj
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 5/250 2026-09-14 21:25 by vZfe6xYu34yj
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组招收博士研究生 +4 两三岁ss 2026-09-14 4/200 2026-09-14 20:29 by 班主任的同桌
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-14 18:01 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-14 17:48 by Aj1rhIDL5ixY
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:13 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-14 15:37 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 6/300 2026-09-14 15:21 by Aj1rhIDL5ixY
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 3/150 2026-09-14 15:09 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 浙江师范大学是怎么坑我的 +6 recruit123 2026-09-09 6/300 2026-09-14 12:00 by 萨仁其其格
[考博] 27秋季材料博士申请求助 10+3 Cahal1 2026-09-11 4/200 2026-09-14 08:50 by 北京莱茵编辑
[教师之家] 浙江师范大学是怎么坑我的 +10 recruit123 2026-09-09 15/750 2026-09-13 10:45 by seaskyy
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭