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五味小丹新虫 (初入文坛)
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[求助]
SSR分子标记读带方法及使用何种软件进行遗传图谱构建较合适
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本人现在构建一植物的遗传连锁图谱,用到的主要分子标记是共显性分子标记SSR。通过查阅文献得知两亲本的分离类型种类达17种之多,目前遇到的主要问题是如何判断两亲本的分离类型,以及如何判断胶板上相邻的两条带是否为等位基因,即读带方法。同时作图群体为全同胞群体,应用何种软件构图较合适,请各位大虾不吝赐教! [ Last edited by 五味小丹 on 2011-6-26 at 20:11 ] |
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xiaohouo0
木虫 (正式写手)
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2楼2011-07-01 13:39:09
小凡198807
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【答案】应助回帖
五味小丹(金币+4): 谢谢!不过我现在最愁的问题是:有部分胶板主带有三条或三条以上,且都靠的较近,都比较像等位基因,不知如何判断 2011-07-01 18:43:51
五味小丹(金币+1): 2011-07-04 15:13:51
五味小丹(金币+5): 2011-09-29 16:24:13
五味小丹(金币+1): 2011-07-04 15:13:51
五味小丹(金币+5): 2011-09-29 16:24:13
| 条带一般选择读取主条带,也就是最亮也是最锐的一个,条带太多的话,说明引物特异性不是很好,扩增的杂带较多,条带少的话,一般用genemarker或者popgene来处理,方法可以在网上查到的,我最近也才做完SSR,反正我是这么读条带的,我师姐的数据我是用genemarker和popgene来处理的 |
3楼2011-07-01 15:19:59











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