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求助各位高手:做SSR分子标记时,只知道上下游引物,请问如何知道所需目的片段的大小
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sweetian2011
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求助
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求助各位高手:做SSR分子标记时,只知道上下游引物,请问如何知道所需目的片段的大小
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求助各位高手:我刚接触SSR,在做SSR分子标记时,跑得垂直电泳有的引物跑出来有四五条带,是否需要知道所需目的片段大小,才能选择自己所要的条带?如果需要知道目的片段大小该用什么方法呢?(引物是我师姐设计的,已经毕业,我只知道上下游引物序列,引物来源不清楚)
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Where there's a will , there's a way!
1楼
2013-03-02 20:57:21
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jishidong
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专业: 作物分子育种
【答案】应助回帖
在ncbi上用blast比对可以估计片段,大小。
非得要用这个引物的话可以提高退火温度,减少非特异条带
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8楼
2013-05-29 22:53:45
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徐小培
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【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
引物上有一段和DNA序列互补的,可以根据这个比对,估测出来!然后和电泳胶上指示的大小进行比对!
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sweetian2011
2楼
2013-03-02 22:09:28
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sweetian2011
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2楼
:
Originally posted by
徐小培
at 2013-03-02 22:09:28
引物上有一段和DNA序列互补的,可以根据这个比对,估测出来!然后和电泳胶上指示的大小进行比对!
再请问一下,那个DNA序列应该在哪找,还是是在NCBI上直接blast,就知道比对结果
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Where there's a will , there's a way!
3楼
2013-03-04 00:13:00
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徐小培
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3楼
:
Originally posted by
sweetian2011
at 2013-03-04 00:13:00
再请问一下,那个DNA序列应该在哪找,还是是在NCBI上直接blast,就知道比对结果...
直接在word中搜索就行吧!你是这个意思吗?
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4楼
2013-03-05 16:31:32
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