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dxli1988

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[求助] 序列比对软件的选择和进化树制作

因为发文章的需要，我要对不同菌种中的三个同工酶基因序列和蛋白序列进行比对，分析其同源性和进化关系，目前我比对的有DNAMAN和DNAStar的MEGAlign两种软件，二者的分析结果不同，而且DNAMAN上给我的感觉是自动空位的，分析结果序列的相似性就较高，而MEGAlign上的分析则空位相对很少，因而相似性较低，所以，请教各位，我该如何均衡这一结果？或者说其他软件来分析呢，请各位指教~

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逆水行舟，不进则退。

1楼 2013-01-08 15:03:23

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

dxli1988

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引用回帖:

7楼: Originally posted by alarace at 2013-01-08 17:03:52
嗯，有个秘密哈，依次点击Alignment→Output format options→Output order中选择Input，然后将所要保存的文件保存到硬盘的根目录下。...

怎么还是秘密呢？嘿嘿···