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汕头大学海洋科学接受调剂
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hyudlut

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] lammps文件可视化问题 已有5人参与

各位大侠求指导,lammps文件如何可视化呢?
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hyudlut

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-12-11 11:35:47
这是因为你还没有弄懂VMD 怎么显示的,你可能还不明白分子拓扑有关的内容吧?

vmd读入的xyz文件,里面仅仅只有原子的坐标信息,没有拓扑信息,而你xyz文件中的原子间的距离如果小于其默认的原子成键的距离,就会 ...

恩,我是一个动力学初学者,对动力学了解很少。如果我想让结果按照我计算前建模的方式连接键,我应该怎么做呢?
7楼2012-12-11 12:36:59
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-12-12 11:45:06
VMD  啊
哈哈哈,你搜索一下论坛里,介绍的可详细了
2楼2012-12-10 22:56:38
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hyudlut

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-12-10 22:56:38
VMD  啊
哈哈哈,你搜索一下论坛里,介绍的可详细了

高手,最近正在研究vmd软件,可是一直没有弄明白,lammps输出xyz坐标直接读取就行吗?
3楼2012-12-11 10:01:05
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-12-12 11:45:13
引用回帖:
3楼: Originally posted by hyudlut at 2012-12-11 10:01:05
高手,最近正在研究vmd软件,可是一直没有弄明白,lammps输出xyz坐标直接读取就行吗?...

当然可以,xyz可以直接读,dump出来的轨迹文件都可以
4楼2012-12-11 10:47:09
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