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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 引物二聚体会不会影响目的基因的迁移?
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曾秀凤

木虫 (正式写手)

[求助] 引物二聚体会不会影响目的基因的迁移?

如题

简单点说：切胶的时候  会不会你切300bp的条带 实际上是350bp或250bp长？

或者 小片段会夹杂在大片段里  你切的大片段里最终还是存在有部分小片段？

两个疑问    大家畅所欲言吧
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1楼 2012-11-24 14:44:10
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yyll1988

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
曾秀凤: 金币+15, ★★★很有帮助, 多谢回帖 大家貌似都一致认为小片段在胶里一定会百分百的比大片段跑的靠前啊 2012-11-26 08:55:30
第一个问题，引物二聚体很小，对跑胶的结果应该没有多大影响。第二段，如果marker给力的话，有专门指示的条带，的话是不会的。当然了也可以加大胶浓度。但胶浓度加大，胶凝固变快，要小心。
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7楼2012-11-25 20:16:37
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as023

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
曾秀凤: 金币+10, ★有帮助, 我们在讨论说 目的片段与引物二聚体可以分的很开的情况下 会不会有部分引物二聚体它缠在目的片段中间 不能通过切胶的方法去除引物二聚体的小片段？ 您觉得有这种可能不 2012-11-26 08:50:00
会。如果maker不好的话，那个带的位置就不对了
引物二聚体在跑胶时一般会在最下面，片段不会太大，100bp左右，如果你的目的片段小的话则有可能混在一起，但是片段大的话引物二聚体不会影响到
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2楼2012-11-24 14:52:21
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seanzhu1996

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
曾秀凤: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢回复 2012-11-26 08:50:28
引物一般比较小，就是几十bp左右，引物双聚体主要会影响PCR的效率和结果，像楼主担心的问题一般不会发生。除非片段非常小，但是那样都可以直接合成了，无需PCR。
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享受每天的生活
3楼2012-11-24 15:12:44
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fendouysys

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
曾秀凤: 金币+5, ★有帮助, 多谢回帖 多交流哟 2012-11-26 08:50:48
这个是个问题，原因不太知道，也碰见过！
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4楼2012-11-24 15:16:30
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