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曾秀凤

木虫 (正式写手)

[求助] 引物二聚体会不会影响目的基因的迁移?

如题

简单点说:切胶的时候  会不会你切300bp的条带 实际上是350bp或250bp长?

或者 小片段会夹杂在大片段里  你切的大片段里最终还是存在有部分小片段?

两个疑问    大家畅所欲言吧
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seanzhu1996

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
曾秀凤: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢回复 2012-11-26 08:50:28
引物一般比较小,就是几十bp左右,引物双聚体主要会影响PCR的效率和结果,像楼主担心的问题一般不会发生。除非片段非常小,但是那样都可以直接合成了,无需PCR。
享受每天的生活
3楼2012-11-24 15:12:44
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as023

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
曾秀凤: 金币+10, 有帮助, 我们在讨论说 目的片段与引物二聚体可以分的很开的情况下 会不会有部分引物二聚体它缠在目的片段中间 不能通过切胶的方法去除引物二聚体的小片段? 您觉得有这种可能不 2012-11-26 08:50:00
会。如果maker不好的话,那个带的位置就不对了
引物二聚体在跑胶时一般会在最下面,片段不会太大,100bp左右,如果你的目的片段小的话则有可能混在一起,但是片段大的话引物二聚体不会影响到
2楼2012-11-24 14:52:21
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fendouysys

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
曾秀凤: 金币+5, 有帮助, 多谢回帖 多交流哟 2012-11-26 08:50:48
这个是个问题,原因不太知道,也碰见过!
4楼2012-11-24 15:16:30
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zhaodahe

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
曾秀凤: 金币+10, ★★★很有帮助, 嗯 我们一般用2%的胶跑 大体能够分开的 关键是我切胶后跑2100芯片发现居然切胶后回收的片段里面发现有小片段没有出除干净 2012-11-26 08:52:09
如果要回收小片段,可以用浓一点儿的凝胶跑产物,会好一些。有的时候两个片段太近,确实很难分开。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2012-11-24 18:47:59
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