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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于RT-PCR中逆转录试剂盒的问题！
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czcpudai

铜虫 (正式写手)

[求助] 关于RT-PCR中逆转录试剂盒的问题！

各位做过逆转录的高手们，本人在2012年6月20日购买到RT试剂盒，到现在快有5个月了，8月份才开始使用。在8月份的时候做RT-PCR目的基因可以扩增出来，等到9月中旬的时候，一直扩增不出目的条带，检测RNAOD比值2.01，电泳效果完整性也比较好，5s不太亮。我想问一下各位，有没有可能是试剂盒中的逆转录酶的活力下降了，反复冻融后活力下降了？我买了后没有分装逆转录酶，只是用的时候从-20度取出来，放在冰盒上操作，再放回-20度。前后如此操作差不多有20次。原因是不是8月份的时候是夏天，气温挺高的（四大火炉之一），酶拿出来后温差太大，这样子，反复冻融操作出现活力下降了！？？ 请分析一下原因，谢谢了！
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1楼 2012-10-15 09:07:31
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czcpudai

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by cicelyzh at 2012-10-15 13:04:22
对于复杂的mRNA来说，例如你做的RNA是人的，最好要变性。否则逆转录的温度较低，复杂结构影响引物与模板结合，cDNA的合成效率降低。一般相对简单的RNA，如原核生物的可以不做变性这一步。...

恩 有道理啊  不过我见到一位同事从人的Hepg2细胞中提取rna做RT-PCR的时候也没有使用这一步，照样可以将1500bp的目的片度扩增出来，试剂盒都是一样的，可能还有其他的原因吧。您说的也很有道理，谢谢了！
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7楼2012-10-15 13:28:26
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czcpudai

铜虫 (正式写手)
再追问一个问题，比如我现在使用的是Biouniquer的试剂盒（肯定比不过英俊和Takara等公司的），现在要想换一下逆转录酶，我想换Takara的逆转录酶，
请问这个可以和Biouniquer的试剂盒想匹配吗？？？ 有没有仁兄经历过这种情况的？？？
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2楼2012-10-15 09:15:19
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-10-15 13:53:06
你的酶都是在冰上操作的话问题应该不大。在-20度的时候酶的stock里有甘油，也不会冻上的，所以不存在冻融问题。只要你做的时候才把酶拿出冰箱，在冰盒上取用后迅速放回冰箱就可以了。你所谓的P不出来是指反转后的cDNA为模板，P不出目的基因还是P什么都没有呢？比如说内参什么的？还有就是你提的RNA是不是立即做了反转录，有没有反复冻融？你做的是什么物种，一般mRNA的半寿期是多少？
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3楼2012-10-15 09:26:25
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by czcpudai at 2012-10-15 09:15:19
再追问一个问题，比如我现在使用的是Biouniquer的试剂盒（肯定比不过英俊和Takara等公司的），现在要想换一下逆转录酶，我想换Takara的逆转录酶，
请问这个可以和Biouniquer的试剂盒想匹配吗？？？ 有没有仁兄经历 ...

公司间的试剂盒不能混搭。而且逆转录的protocol各个公司的也不完全一样。
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4楼2012-10-15 09:28:31
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