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czcpudai

铜虫 (正式写手)

[求助] 关于RT-PCR中逆转录试剂盒的问题!

各位做过逆转录的高手们,本人在2012年6月20日购买到RT试剂盒,到现在快有5个月了,8月份才开始使用。在8月份的时候做RT-PCR目的基因可以扩增出来,等到9月中旬的时候,一直扩增不出目的条带,检测RNAOD比值2.01,电泳效果完整性也比较好,5s不太亮。我想问一下各位,有没有可能是试剂盒中的逆转录酶的活力下降了,反复冻融后活力下降了?我买了后没有分装逆转录酶,只是用的时候从-20度取出来,放在冰盒上操作,再放回-20度。前后如此操作差不多有20次。原因是不是8月份的时候是夏天,气温挺高的(四大火炉之一),酶拿出来后温差太大,这样子,反复冻融操作出现活力下降了!?? 请分析一下原因,谢谢了!
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tulip1213

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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小丹木木: 金币+3, 鼓励积极交流问题 2012-10-17 14:48:48
有可能是RNA降解了,理论上RNA和cDNA放-80冰箱没问题,但是我发现放置不能超过一个月。RNA,跑电泳看不出啥,实际上还是降解的;最好做个逆转录,cDNA跑电泳检测完整性。总之,酶没有问题,是RNA的问题。帮同学做过逆转录,由于RNA样品是溶解在乙醇中寄过来的,第一次,没有及时处理,放了一个月,RT-PCR不成功;第二次寄过来,及时处理并逆转录,目的基因就被扩出来了。
9楼2012-10-16 18:20:17
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tulip1213

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-10-17 14:49:33
引用回帖:
10楼: Originally posted by czcpudai at 2012-10-16 18:52:28
谢谢!cDNA跑电泳怎么样检测其完整性?没听说过cDNA还要跑电泳的啊?电泳显示什么效果才说明cDNA是好的呢???
还有我想问一下,您的逆转录的试剂盒是哪家公司的??谢谢!...

取3-5微升cDNA跑电泳,看一下条带的弥散情况,应该是从低分子量到高分子量分布均匀。我自己曾经有过类似你的经历,需要重新克隆基因。从-80冰箱取的RNA,跑电泳,看不出降解,但是P不出来,后来检测了cDNA,cDNA不完整。后来重提RNA的。
我用的酶是promega的,一向是对折销售的那款,要另外订RNA酶抑制剂。
15楼2012-10-17 11:15:25
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tulip1213

银虫 (小有名气)

内参一般是组成表达的基因,内参P出来一定能p出目的基因?
16楼2012-10-17 11:19:32
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