应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 引物设计 求助
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 1173  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhlf1989513

金虫 (小有名气)

[求助] 引物设计 求助

我的基因是个假基因，pubmed上名为CYP4Z2P，我想P一下它的ＣＤＳ区，谁能帮我设计一下引物，我设计了很多对引物试了很多次都不成功，甚是郁闷！！！
ＣＤＳ去序列为：
４atggagc cctcctggct tcaggaactc atggctcacc ccttcttgct gctgatcctc
61  ctctgcatgt ctctgctgct gtttcaggta atcaggttgt accagaggag gagatggacg
121 atcagagcca tgcacctgtt tcctgcaccc cctgcgcact ggttctatgg ccacaaggag
181 tcttacccag taaaagagtt tgaggtgtat cctgagctga tggaaaaata cccatgtgcc
241 gttcccttgt gggttggacc ctttacgatg ttcttcaata tccatgaccc agactatgtc
301 aagattctcc tgaaaagaca agatcccaaa agtgctgtta gccacaaaat ccttgaatcc
361 tgggttggtc gaggacttgt gaccctggat ggttctaaat ggaaaaagca ccgccagatt
421 gtgaaacctg gcttcaacat cagcattctg aaaatattca tcaccatgat gtctaagagt
481 gttcggatga tgctgaacaa atgggaggaa cacattgccc aaaactcacg tctggagctc
541 tttcaacatg tctccctgat gaccctggac agcatcatga agtgtgcctt cagccaccag
601 ggcagcatcc agttggacag taccctggac tcatacctga aagcagtgtt caaccttagc
661 aaaatctcca accagcgcat gaacaatttt ctacatcaca acgacctggt tttcaaattc
721 agctctcaag gccaaatctt ttctaaattt aaccaagaac ttcatcagtt cacagagaaa
781 gtaatccagg accggaagga gtctcttaag gataagctaa aacaagatac tactcagaaa
841 agacgccagg attttctgga catacttttg agtgccaaaa gtgaaaacac caaagacttc
901 tctgaagcag atctccaagc tgaagtgaaa acgttcatgt ttgcaggaca tgacaccaca
961 actactgcta tctcctggat cttttactgc ttggcaaagt accctgagca tcagcagaga
1021 tgctg

[ Last edited by 1949stone on 2012-10-8 at 07:30 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
keepon
1楼 2012-10-07 14:28:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ysn5048

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-28 17:46:35
引用回帖:
8楼: Originally posted by review at 2012-10-25 17:15:47
序列是固定的。那取上游引物取原序列前20位左右？不是从第一个碱基开始吗  如原始序列：tatca........   ，加入从第二个碱基a开始   那会不会漏了前面tatc？那批出来还是全的吗    我是初学者  来学习的  请指教啊...

如果楼主从第二个碱基a开始，那么意思是引物应该是atca...，请放心，是不是漏了前面楼主说的tatc的，因为楼主设计的引物包括了tatc中的atc。还有就是一般开放读码框开始都是ATG，起始密码子
赞一下 回复此楼
有时候，一句话，可以改变未来
9楼2012-10-28 12:25:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

ysn5048

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-07 17:26:09
楼主用什么作为模板的，是否可以肯定模板没有问题呢
另外，这段CDS序列是固定的话，那么楼主设计的引物其实也就固定了，不用加保护碱基，直接上游引物取原序列前20位左右，下游引物取互补序列后20位左右
赞一下 回复此楼
有时候，一句话，可以改变未来
2楼2012-10-07 14:40:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

天空2011

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-28 17:46:03
想问一下楼主干什么用？用不用加酶切位点？个人感觉还是5端加三个保护碱基的好，要是用酶切位点的话在5端依次为三个保护碱基+酶切位点
+20bp的碱基序列，3端为后20bp碱基的反向互补序列，在其5端加保护碱基和酶切位点
赞一下 回复此楼
3楼2012-10-07 15:06:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhlf1989513

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ysn5048 at 2012-10-07 14:40:43
楼主用什么作为模板的，是否可以肯定模板没有问题呢
另外，这段CDS序列是固定的话，那么楼主设计的引物其实也就固定了，不用加保护碱基，直接上游引物取原序列前20位左右，下游引物取互补序列后20位左右

对呀，因为我得研究它的功能，所以就像你说那样上下游各取１８到２５位之间的序列就行。用的细胞提取的ＲＮＡ然后逆转录的ｃＤＮＡ为模板呀。。。其实关键是我设计的引物在ＮＣＢＩ里ＢＬＡＳＴ时，不能ＢＬＡＳＴ出来我的目的基因，而是其他的基因。。。因为我这个是假基因，所以和正基因的同源性很高，所以ＢＬＡＳＴ时只能把正基因ＢＬＡＳＴ出来。我的目的基因不能BLAST出来。。郁闷死了。。。
赞一下 回复此楼
keepon
4楼2012-10-07 15:15:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料专硕 085600求调剂 +5 BBQ233 2026-03-30 5/250 2026-03-30 12:15 by 学员8dgXkO
[考研] 085601材料工程找调剂 +16 oatmealR 2026-03-29 17/850 2026-03-30 11:04 by w虫虫123
[考研] 085600 材料与化工 329分求调剂 +14 Mr. Z 2026-03-25 14/700 2026-03-29 17:27 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿太原理工安全工程300分，求调剂 +5 0857求调剂. 2026-03-24 6/300 2026-03-28 22:04 by zhq0425
[考研] 071000生物学求调剂，初试成绩343 +7 小小甜面团 2026-03-25 7/350 2026-03-28 20:25 by 唐沐儿
[考研] 压国家一区线，求导师收留，有恩必谢！ +7 迷人的哈哈 2026-03-28 7/350 2026-03-28 16:47 by 催化大白
[考研] 调剂 +3 好好读书。 2026-03-28 3/150 2026-03-28 12:04 by 王保杰33
[考研] 286求调剂 +4 丢掉懒惰 2026-03-27 7/350 2026-03-28 08:07 by baoball
[考研] 求调剂推荐 材料 304 +15 荷包蛋hyj 2026-03-26 15/750 2026-03-28 04:13 by fmesaito
[考研] 331环境科学与工程求调剂 +3 熠然好运气 2026-03-27 3/150 2026-03-28 04:11 by fmesaito
[考研] 285求调剂 +4 AZMK 2026-03-27 7/350 2026-03-27 20:59 by AZMK
[考研] 266求调剂 +11 阳阳哇塞 2026-03-27 12/600 2026-03-27 17:56 by yu221
[硕博家园] 北京林业大学硕导招生广告 +6 kongweilin 2026-03-26 8/400 2026-03-27 10:18 by FF_16
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +4 崔wj 2026-03-26 4/200 2026-03-27 08:04 by chemisry
[考研] 生物学 296 求调剂 +4 朵朵- 2026-03-26 6/300 2026-03-26 19:01 by 不吃魚的貓
[考研] 085602化学工程求调剂。 +4 平乐乐乐 2026-03-26 4/200 2026-03-26 17:57 by fmesaito
[考研] 303求调剂 +6 蓝山月 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:47 by 418490947
[考研] 07化学303求调剂 +5 睿08 2026-03-25 5/250 2026-03-25 22:46 by 418490947
[考研] 0854AI CV方向招收调剂 +4 章小鱼567 2026-03-23 4/200 2026-03-25 17:04 by CoderLoser
[考研] 086003食品工程求调剂 +6 淼淼111 2026-03-24 6/300 2026-03-25 10:29 by 3Strings
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭