应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 引物设计 求助
51/1返回列表
查看: 1428  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhlf1989513

金虫 (小有名气)

[求助] 引物设计 求助

我的基因是个假基因，pubmed上名为CYP4Z2P，我想P一下它的ＣＤＳ区，谁能帮我设计一下引物，我设计了很多对引物试了很多次都不成功，甚是郁闷！！！
ＣＤＳ去序列为：
４atggagc cctcctggct tcaggaactc atggctcacc ccttcttgct gctgatcctc
61  ctctgcatgt ctctgctgct gtttcaggta atcaggttgt accagaggag gagatggacg
121 atcagagcca tgcacctgtt tcctgcaccc cctgcgcact ggttctatgg ccacaaggag
181 tcttacccag taaaagagtt tgaggtgtat cctgagctga tggaaaaata cccatgtgcc
241 gttcccttgt gggttggacc ctttacgatg ttcttcaata tccatgaccc agactatgtc
301 aagattctcc tgaaaagaca agatcccaaa agtgctgtta gccacaaaat ccttgaatcc
361 tgggttggtc gaggacttgt gaccctggat ggttctaaat ggaaaaagca ccgccagatt
421 gtgaaacctg gcttcaacat cagcattctg aaaatattca tcaccatgat gtctaagagt
481 gttcggatga tgctgaacaa atgggaggaa cacattgccc aaaactcacg tctggagctc
541 tttcaacatg tctccctgat gaccctggac agcatcatga agtgtgcctt cagccaccag
601 ggcagcatcc agttggacag taccctggac tcatacctga aagcagtgtt caaccttagc
661 aaaatctcca accagcgcat gaacaatttt ctacatcaca acgacctggt tttcaaattc
721 agctctcaag gccaaatctt ttctaaattt aaccaagaac ttcatcagtt cacagagaaa
781 gtaatccagg accggaagga gtctcttaag gataagctaa aacaagatac tactcagaaa
841 agacgccagg attttctgga catacttttg agtgccaaaa gtgaaaacac caaagacttc
901 tctgaagcag atctccaagc tgaagtgaaa acgttcatgt ttgcaggaca tgacaccaca
961 actactgcta tctcctggat cttttactgc ttggcaaagt accctgagca tcagcagaga
1021 tgctg

[ Last edited by 1949stone on 2012-10-8 at 07:30 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
keepon
1楼 2012-10-07 14:28:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

天空2011

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-28 17:46:03
想问一下楼主干什么用？用不用加酶切位点？个人感觉还是5端加三个保护碱基的好，要是用酶切位点的话在5端依次为三个保护碱基+酶切位点
+20bp的碱基序列，3端为后20bp碱基的反向互补序列，在其5端加保护碱基和酶切位点
赞一下 回复此楼
3楼2012-10-07 15:06:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

ysn5048

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-07 17:26:09
楼主用什么作为模板的，是否可以肯定模板没有问题呢
另外，这段CDS序列是固定的话，那么楼主设计的引物其实也就固定了，不用加保护碱基，直接上游引物取原序列前20位左右，下游引物取互补序列后20位左右
赞一下 回复此楼
有时候，一句话，可以改变未来
2楼2012-10-07 14:40:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhlf1989513

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ysn5048 at 2012-10-07 14:40:43
楼主用什么作为模板的，是否可以肯定模板没有问题呢
另外，这段CDS序列是固定的话，那么楼主设计的引物其实也就固定了，不用加保护碱基，直接上游引物取原序列前20位左右，下游引物取互补序列后20位左右

对呀，因为我得研究它的功能，所以就像你说那样上下游各取１８到２５位之间的序列就行。用的细胞提取的ＲＮＡ然后逆转录的ｃＤＮＡ为模板呀。。。其实关键是我设计的引物在ＮＣＢＩ里ＢＬＡＳＴ时，不能ＢＬＡＳＴ出来我的目的基因，而是其他的基因。。。因为我这个是假基因，所以和正基因的同源性很高，所以ＢＬＡＳＴ时只能把正基因ＢＬＡＳＴ出来。我的目的基因不能BLAST出来。。郁闷死了。。。
赞一下 回复此楼
keepon
4楼2012-10-07 15:15:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhlf1989513

金虫 (小有名气)
阁下。。。我这个每次BLAST时都不能BLAST出我的目的基因啊。。。我想研究的这个基因是个假基因。。。
赞一下 回复此楼
keepon
5楼2012-10-07 15:17:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 2rKfVQg2jQww 2026-11-06 16/800 2026-11-09 06:54 by l48hFd8Nwae2
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 15/750 2026-11-09 06:43 by l48hFd8Nwae2
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 14/700 2026-11-09 06:39 by l48hFd8Nwae2
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 12/600 2026-11-09 06:32 by l48hFd8Nwae2
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 12/600 2026-11-09 05:26 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 9/450 2026-11-08 22:46 by l48hFd8Nwae2
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 14/700 2026-11-06 16:32 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +7 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 17/850 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +7 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 14/700 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 14/700 2026-11-06 13:36 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 18/900 2026-11-06 13:36 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 10/500 2026-11-06 12:32 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 5/250 2026-11-06 09:01 by 2lRNluKrJpwL
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 kvewwGtKktqB 2026-11-04 11/550 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:15 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 10/500 2026-11-06 01:51 by qL1cU46YIdK0
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-05 11:10 by PYZmcHr5kSaq
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭