| 查看: 1379 | 回复: 5 | |||
[交流]
分子动力学模拟中有可能出现混沌现象吗？
|
|
我不是学物理的，甚至大学物理都没有学过。关于混沌（CHAOS）我只是从一些科普书籍或是纪录片中有所了解，我对它印象很深，因为这是个很“酷”的概念——完全决定性的系统也可以出现无法预测的现象。那么像分子动力学这样一个基于经典力学的模拟过程，是否也可能出现结果迥异的混沌现象呢？ 之所以想起这个问题是因为我在模拟过程中发现同样一个体系，同样的模拟参数，最后得出了完全不同的结果。我认为这应该是初始赋予的原子速度不一样所致，但是会不会和混沌有什么关系呢？解答这个问题需要有很好的物理基础，同时又理解分子动力学的过程，希望板上有这样的大牛！ [ 来自科研家族 化学生物学 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有5人回复
-
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有10人回复
-
天津大学招2026.09的博士生，欢迎大家推荐交流（博导是本人）
已经有9人回复
-
有院领导为了换新车，用横向课题经费买了俩车
已经有10人回复
-
同年申请2项不同项目，第1个项目里不写第2个项目的信息，可以吗
已经有5人回复
-
遇见不省心的家人很难过
已经有24人回复
-
AI 太可怕了，写基金时，提出想法，直接生成的文字比自己想得深远，还有科学性
已经有6人回复
-
酰胺脱乙酰基
已经有13人回复
-
有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福
已经有10人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 分子动力学模拟时间的意义？
已经有15人回复
- 最近在学习分子动力学模拟，不知道castep跑分子动力学效果如何呢？
已经有12人回复
- 分子动力学模拟“边界问题”含义
已经有10人回复
- 对接的分子用于分子动力学模拟的问题
已经有12人回复
- Amber 分子动力学 求助！！！！
已经有10人回复
- 请问，分子动力学模拟和分子力学模拟的区别是什么呢？
已经有7人回复
- 水分子的分子动力学模拟中水分子跑出盒子
已经有10人回复
- 关于MS做分子动力学的问题
已经有8人回复
- 分子动力学的时间
已经有9人回复
- 分子动力学模拟中的系综问题
已经有5人回复
- 分子动力学模拟时如何利用周期性边界条件？？
已经有5人回复
- 分子动力学模拟完毕之后要怎么分析结果阿
已经有7人回复
- 请教各位，分子动力学模拟NVE系统，不对速度进行标度可以吗？
已经有7人回复
- 【求助】VASP做分子动力学模拟NVT系综下为啥内能竟然是升高的？
已经有8人回复
- 分子模拟时间越长越好吗？
已经有44人回复
- 请问各位熟悉分子动力学模拟的朋友，熟悉精通MS的分子动力学模拟需要多久？
已经有17人回复
- 【求助】MS如何实现水分子与SiO2反应的分子动力学模拟过程（想得到Si-OH键）？
已经有21人回复
- 【求助】关于vasp进行分子动力学模拟的求助
已经有12人回复
- 【求助】分子动力学模拟尺度问题？
已经有11人回复
- 【求助】请教分子动力学模拟
已经有8人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
-大龄未婚男找女朋友结婚
+1/242
-
湖南大学材料院陶益杰老师招收2026年联合培养硕士学生一名
+1/182
-
威格焊接手套箱：稳定惰性环境，实现节能降本
+1/83
-
广州大学“长江学者”教授团队2026年海内外高层次人才招聘（环境/化学/生物）
+1/78
-
中国科学院深圳先进技术研究院——招聘博士后
+3/62
-
同济大学脑机智能团队脑机接口方向招生招聘
+1/36
-
同济大学脑机智能团队脑机接口方向招生招聘
+1/33
-
香港城市大学软物质课题组现招收博士研究生 2026.09 入学
+1/32
-
深圳大学信息功能电子材料方向“申请-考核制”博士生招生
+2/20
-
中国科学技术大学环境系招生
+1/13
-
深圳大学柔性电子材料方向“申请-考核制”博士生招生
+2/12
-
中南林业科技大学生物质绿色转化与功能材料课题组2026年博士招生
+1/12
-
南京医科大学国家级高层次青年人才团队招收博士研究生
+1/8
-
招收中国CSC或学校资助联培博士生/访问学生-- Tsinghua-A*STAR 2025 Joint Funding
+1/8
-
北京工业大学化生学院青年教师或“青年优秀人才”招聘启事
+1/6
-
化学行业，研发出创新的东西是做成项目给公司吃提成，还是自己搞小作坊倒卖？
+1/6
-
考博求助
+1/3
-
国家“双一流”建设高校-南京林业大学-国家级青年人才团队招聘 2026级博士研究生
+1/3
-
【经验分享】CRISPR基因敲除细胞系构建全流程踩坑指南——从递送方式选择到克隆筛选
+1/2
-
求资源
+1/1
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
ValYu: 金币+5, 好文章，多谢！ 2012-09-06 14:27:47
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
ValYu: 金币+5, 好文章，多谢！ 2012-09-06 14:27:47
|
推荐一篇文章，http://dx.doi.org/10.1021/jp953409x 可能是第一篇讲MD中的混沌现象。 MD中的混沌，比较接近于分叉现象 |
2楼2012-09-05 08:48:03
3楼2012-11-12 18:48:51
4楼2014-08-24 15:21:17
5楼2014-08-25 08:46:23
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
经典力学中，只要是三体或者三体以上的问题，都是混沌(chaotic)的，也就是说没有解析解，而数值解由于误差的存在，求解的粒子的轨迹与粒子实际轨迹的误差随着时间的增加会指数级的增长(Lyapunov Instability，参见Understanding Molecular Simulation, Chapter 4.3.4)。所以对于MD，除非你只求解两个粒子的运动，否则体系必然是混沌的。 但MD并不关心粒子在相空间中的单条轨迹的精确求解，MD求的是系综平均，也就是能够把系综所包含的相空间的点都走遍，即ergodicity。对于平衡态的性质，只要能实现ergodicity，所求的平均值就是准确的，与你粒子轨迹算得准确不准确没关系，所以对于平衡态的性质，理论上讲MD和MC的结果是没区别的，区别在于采样的过程。对于涉及动力学的性质（比如扩散）的计算，由于MD计算得到的轨迹和真实情况下的轨迹是有误差的，所以计算的动力学性质也是有误差的，但这个误差并不是无限大，而是有界的，因而MD计算的动力学性质还是有实际意义的。 |
6楼2014-08-25 09:37:35