| 查看: 1882 | 回复: 5 | |||
[交流]
分子动力学模拟中有可能出现混沌现象吗？
|
|
我不是学物理的，甚至大学物理都没有学过。关于混沌（CHAOS）我只是从一些科普书籍或是纪录片中有所了解，我对它印象很深，因为这是个很“酷”的概念——完全决定性的系统也可以出现无法预测的现象。那么像分子动力学这样一个基于经典力学的模拟过程，是否也可能出现结果迥异的混沌现象呢？ 之所以想起这个问题是因为我在模拟过程中发现同样一个体系，同样的模拟参数，最后得出了完全不同的结果。我认为这应该是初始赋予的原子速度不一样所致，但是会不会和混沌有什么关系呢？解答这个问题需要有很好的物理基础，同时又理解分子动力学的过程，希望板上有这样的大牛！ [ 来自科研家族 化学生物学 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有6人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有9人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有9人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有6人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有9人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有10人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有6人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有12人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有13人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 分子动力学模拟时间的意义？
已经有15人回复
- 最近在学习分子动力学模拟，不知道castep跑分子动力学效果如何呢？
已经有12人回复
- 分子动力学模拟“边界问题”含义
已经有10人回复
- 对接的分子用于分子动力学模拟的问题
已经有12人回复
- Amber 分子动力学 求助！！！！
已经有10人回复
- 请问，分子动力学模拟和分子力学模拟的区别是什么呢？
已经有7人回复
- 水分子的分子动力学模拟中水分子跑出盒子
已经有10人回复
- 关于MS做分子动力学的问题
已经有8人回复
- 分子动力学的时间
已经有9人回复
- 分子动力学模拟中的系综问题
已经有5人回复
- 分子动力学模拟时如何利用周期性边界条件？？
已经有5人回复
- 分子动力学模拟完毕之后要怎么分析结果阿
已经有7人回复
- 请教各位，分子动力学模拟NVE系统，不对速度进行标度可以吗？
已经有7人回复
- 【求助】VASP做分子动力学模拟NVT系综下为啥内能竟然是升高的？
已经有8人回复
- 分子模拟时间越长越好吗？
已经有44人回复
- 请问各位熟悉分子动力学模拟的朋友，熟悉精通MS的分子动力学模拟需要多久？
已经有17人回复
- 【求助】MS如何实现水分子与SiO2反应的分子动力学模拟过程（想得到Si-OH键）？
已经有21人回复
- 【求助】关于vasp进行分子动力学模拟的求助
已经有12人回复
- 【求助】分子动力学模拟尺度问题？
已经有11人回复
- 【求助】请教分子动力学模拟
已经有8人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
东北大学应用经济学博士招生-2027级
+1/982
-
讨论一下
+1/293
-
北师大董越老师团队招收27级硕士/博士-环境系统分析/人类-自然耦合系统建模
+3/281
-
27博士申请
+1/181
-
南开大学罗景山教授课题组招收2027年入学博士生
+2/100
-
科研涂膜制样 HK‑5000AZ 真空型实验室小型涂布试验机｜线棒 / 刮刀双模式
+1/92
-
中国地质大学（北京）海洋学院关翔宇教授课题组招收2027级博士研究生
+1/50
-
海南大学化学化工学院姜忠义膜科学与膜技术团队2027年第一批博士招生
+1/35
-
2027 年 CSC 博士招生｜荷兰奈梅亨大学 · 唐德斯研究院
+1/27
-
哈尔滨工程大学 · 先进核动力装置课题组 · 2027年博士招生
+1/18
-
南京大学课题组招收博士生
+1/15
-
2027 年 CSC 博士招生｜荷兰奈梅亨大学 · 唐德斯研究院
+1/13
-
先寻求丙烯酸胶水开发合作伙伴
+1/10
-
欢迎报考北师大（珠海）余雯教授团队环境科学学术学位博士研究生
+1/6
-
中科院大连化物所张涛院士团队诚聘优秀博士后人才
+1/5
-
西南交通大学李义兵课题组博士及青年英才招聘
+1/4
-
您感兴趣的遗传病是哪些？您认为产前诊断在阻断遗传病传递作用有多大？
+1/4
-
西南交通大学李义兵课题组博士及青年英才招聘
+1/3
-
中科院大连化物所张涛院士团队诚聘优秀博士后人才
+1/3
-
各类型分子筛定制加工，技术方案
+1/2
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
ValYu: 金币+5, 好文章，多谢！ 2012-09-06 14:27:47
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
ValYu: 金币+5, 好文章，多谢！ 2012-09-06 14:27:47
|
推荐一篇文章，http://dx.doi.org/10.1021/jp953409x 可能是第一篇讲MD中的混沌现象。 MD中的混沌，比较接近于分叉现象 |
2楼2012-09-05 08:48:03
3楼2012-11-12 18:48:51
4楼2014-08-24 15:21:17
5楼2014-08-25 08:46:23
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
|
经典力学中，只要是三体或者三体以上的问题，都是混沌(chaotic)的，也就是说没有解析解，而数值解由于误差的存在，求解的粒子的轨迹与粒子实际轨迹的误差随着时间的增加会指数级的增长(Lyapunov Instability，参见Understanding Molecular Simulation, Chapter 4.3.4)。所以对于MD，除非你只求解两个粒子的运动，否则体系必然是混沌的。 但MD并不关心粒子在相空间中的单条轨迹的精确求解，MD求的是系综平均，也就是能够把系综所包含的相空间的点都走遍，即ergodicity。对于平衡态的性质，只要能实现ergodicity，所求的平均值就是准确的，与你粒子轨迹算得准确不准确没关系，所以对于平衡态的性质，理论上讲MD和MC的结果是没区别的，区别在于采样的过程。对于涉及动力学的性质（比如扩散）的计算，由于MD计算得到的轨迹和真实情况下的轨迹是有误差的，所以计算的动力学性质也是有误差的，但这个误差并不是无限大，而是有界的，因而MD计算的动力学性质还是有实际意义的。 |
6楼2014-08-25 09:37:35
