24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2284  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

156348820

木虫 (小有名气)

[求助] 16SDNA-PCR产物测序结果拿到后该如何处理?

16SDNA-PCR测序结果出来了,该怎么处理测序结果啊?还是直接就BLAST?因为我做了2个重复,而且都是双向测序,重复之间的长度还不一样。。。所以感觉需要去掉某些碱基,

用DNAMAN比较了一下两条互补链,发现,从432到999才是完全重合的,是否需要拿这完全重合的区域去BLAST吗?

Upper line: Reverse_Complement_1.seq, from 1 to 568
Lower line: 1.seq, from 432 to 999

Reverse_Complement_1.seq:1.seq identity= 100.00%(568/568) gap=0.00%(0/568)

求解啊? 拿到测序结果到底应该如何处理啊?我的目的是为了鉴定
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ybfang

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 156348820 at 2012-08-26 20:22:57
还有一个疑问就是在BLAST后,得到N多个同源性较高的结果,到底选择那些来构建系统发育树?

选择最相近的几个。还有选一些种属距离远的做对照。不过建树我是自己偷偷学的。其实我是中药学的。
共勉!!!!
6楼2012-08-27 20:07:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

ybfang

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
156348820: 金币+5, 有帮助 2012-08-27 19:35:54
鉴定菌种就直接blast啦。两个分别blast。应该可以得到属
共勉!!!!
2楼2012-08-25 14:41:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

156348820

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ybfang at 2012-08-25 14:41:25
鉴定菌种就直接blast啦。两个分别blast。应该可以得到属

是不是正反序列需要拼接啊?我每个测序结果就只有1000bp但是,blast结果中人家的都有1400以上的BP啊?
3楼2012-08-26 18:30:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

156348820

木虫 (小有名气)

还有一个疑问就是在BLAST后,得到N多个同源性较高的结果,到底选择那些来构建系统发育树?
4楼2012-08-26 20:22:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +21 111623 2026-04-04 23/1150 2026-04-07 02:16 by BruceLiu320
[考研] 302分求调剂 一志愿安徽大学085601 +12 zyx上岸! 2026-04-04 12/600 2026-04-07 02:09 by BruceLiu320
[考研] 336求调剂,一志愿中科大 +6 墨彧 yuyu 2026-04-06 6/300 2026-04-06 23:19 by zzchen2000
[考研] 华南理工0703化学,总分336求调剂 +10 手机用户 2026-04-03 11/550 2026-04-06 22:20 by michael2011
[考研] 318求调剂 +12 ykyhsa 2026-04-05 14/700 2026-04-06 17:46 by fuyu_
[考研] 材料专硕322 +11 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-05 11/550 2026-04-06 14:07 by lqwchd
[考研] 324求调剂 +3 k可乐 2026-04-05 4/200 2026-04-06 09:54 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿南昌大学,085600,344分求调剂 +9 调剂上岸玘 2026-04-05 10/500 2026-04-06 09:30 by dongzh2009
[考研] 348求调剂 +3 车厘子zzz 2026-04-05 3/150 2026-04-05 20:30 by 啵啵啵0119
[考研] 材料调剂 +13 一样YWY 2026-04-03 14/700 2026-04-05 18:20 by 蓝云思雨
[考研] 266分,一志愿电气工程,本科材料,求材料专业调剂 +11 哇呼哼呼哼 2026-04-01 12/600 2026-04-04 23:17 by 永字号
[考研] 11408,335分,本科211,求调剂,可转专业 +5 鳄梨大鳄鱼 2026-04-03 5/250 2026-04-04 22:49 by chongya
[考研] 085701求调剂 +7 龚禹铭 2026-04-04 8/400 2026-04-04 13:49 by 小小树2024
[考研] 土木304求调剂 +4 兔突突突, 2026-03-31 4/200 2026-04-04 13:34 by 1753564080
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-04-02 3/150 2026-04-02 15:06 by cal0306
[考研] 土木304求调剂 +6 兔突突突, 2026-03-31 7/350 2026-04-02 09:06 by coolminer
[考研] 326求调剂 +4 崽崽仔 2026-03-31 4/200 2026-04-01 09:58 by 我的船我的海
[考研] 一志愿 南京航空航天大学 ,080500材料科学与工程学硕 +10 @taotao 2026-03-31 11/550 2026-04-01 09:43 by xiayizhi
[考研] 土木304求调剂 +5 顶级擦擦 2026-03-31 5/250 2026-04-01 08:15 by fdcxdystjk¥
[考研] 085404 22408 315分 +5 zhuangyan123 2026-03-31 6/300 2026-03-31 13:48 by limeifeng
信息提示
请填处理意见