24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2282  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

156348820

木虫 (小有名气)

[求助] 16SDNA-PCR产物测序结果拿到后该如何处理?

16SDNA-PCR测序结果出来了,该怎么处理测序结果啊?还是直接就BLAST?因为我做了2个重复,而且都是双向测序,重复之间的长度还不一样。。。所以感觉需要去掉某些碱基,

用DNAMAN比较了一下两条互补链,发现,从432到999才是完全重合的,是否需要拿这完全重合的区域去BLAST吗?

Upper line: Reverse_Complement_1.seq, from 1 to 568
Lower line: 1.seq, from 432 to 999

Reverse_Complement_1.seq:1.seq identity= 100.00%(568/568) gap=0.00%(0/568)

求解啊? 拿到测序结果到底应该如何处理啊?我的目的是为了鉴定
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ybfang

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
156348820: 金币+15, 有帮助 2012-08-27 19:36:01
引用回帖:
3楼: Originally posted by 156348820 at 2012-08-26 18:30:29
是不是正反序列需要拼接啊?我每个测序结果就只有1000bp但是,blast结果中人家的都有1400以上的BP啊?...

我以前也遇过这种拼接后才900左右的。但不管长短Blast一下看结果先。如果怀疑拼接出错,可以blast测序公司发来的两个seq文件——也就是单侧的序列(记事本打开),估计两个都是差不多种属的。
共勉!!!!
5楼2012-08-26 20:29:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

ybfang

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
156348820: 金币+5, 有帮助 2012-08-27 19:35:54
鉴定菌种就直接blast啦。两个分别blast。应该可以得到属
共勉!!!!
2楼2012-08-25 14:41:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

156348820

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ybfang at 2012-08-25 14:41:25
鉴定菌种就直接blast啦。两个分别blast。应该可以得到属

是不是正反序列需要拼接啊?我每个测序结果就只有1000bp但是,blast结果中人家的都有1400以上的BP啊?
3楼2012-08-26 18:30:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

156348820

木虫 (小有名气)

还有一个疑问就是在BLAST后,得到N多个同源性较高的结果,到底选择那些来构建系统发育树?
4楼2012-08-26 20:22:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿苏州大学材料工程(085601)专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +11 大火山小火山 2026-04-05 11/550 2026-04-06 22:55 by yunlongyang
[考研] 一志愿吉大化学327求调剂 +6 王王白石 2026-04-06 7/350 2026-04-06 21:46 by dongzh2009
[考研] 336材料与化工085600求调剂 +9 水星记infp 2026-04-05 12/600 2026-04-06 11:46 by 水星记infp
[考研] 材料334求调剂 +19 Eecho# 2026-04-03 19/950 2026-04-06 08:37 by 小小树2024
[考研] 301求调剂 +6 细胞相关蛋白 2026-04-02 10/500 2026-04-06 08:34 by jp9609
[考研] 一志愿211,化学学硕,310分,本科重点双非,求调剂 +13 努力奋斗112 2026-04-04 13/650 2026-04-06 07:13 by jj987
[考研] 308求调剂 +3 终不似从前 2026-04-05 3/150 2026-04-05 22:23 by hemengdong
[考研] 296求调剂 +3 汪!?! 2026-04-05 5/250 2026-04-05 17:38 by 蓝云思雨
[考研] 085600调剂 +9 东照照照 2026-04-04 9/450 2026-04-05 13:44 by ujn_zhuj
[考研] 290求调剂 +7 luoziheng 2026-04-04 7/350 2026-04-04 23:17 by lqwchd
[考研] 283求调剂 +4 mcbbc 2026-04-03 5/250 2026-04-04 20:51 by imissbao
[考研] 348分环境工程·调剂 +10 吴彦祖24k 2026-04-03 11/550 2026-04-04 14:19 by 无际的草原
[考研] 322求调剂 +6 FZAC123 2026-04-03 6/300 2026-04-03 22:23 by 科研小专家
[考研] 数二英二348求调剂 +4 hxdzj1 2026-04-03 5/250 2026-04-03 21:25 by zhq0425
[考研] 325分化学调剂 +5 15771691647 2026-04-02 5/250 2026-04-03 09:58 by ChemPharm
[考研] 326求调剂 +10 崽崽仔 2026-04-02 10/500 2026-04-03 09:08 by 帕尔马拉特
[考研] 296求调剂 +4 sdhu 2026-04-02 4/200 2026-04-02 21:29 by baoball
[考研] 324求调剂 +5 想上学求调 2026-04-01 6/300 2026-04-02 10:16 by sanrepian
[考研] 一志愿安徽大学计算机科学与技术学硕,331分求调剂 +5 蒋昌鹏qtj 2026-04-01 5/250 2026-04-02 08:10 by fxue1114
[考研] 0855机械初试280求调剂 +3 kazenotori 2026-03-31 3/150 2026-04-01 10:08 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见