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汕头大学海洋科学接受调剂
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wygcsu

木虫 (小有名气)

[交流] 系统发育树bootsrap 已有5人参与

为什么在构建系统发育树时,一些节点没有bootsrap值,不知道什么意思,是可靠还是不可靠?bootsrap值究竟代表什么意思?是怎么得来的?为什么有的是几百,有的树却是几十?求大侠们解释

[ Last edited by wygcsu on 2012-8-6 at 09:38 ]
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lymkitty

新虫 (小有名气)


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Bootstrap(进化树)
即自展值,是用来检验你所计算的进化树分支可信度的。简单地讲就是把序列的位点都重排,重排后的序列再用相同的办法构树,如果原来树的分枝在重排后构的树中也出现了,就给这个分枝打上一分,如果没出现就给0分,这样经过你给定的repetitions次(至少1000次)重排构树打分后,每个分枝就都得出分值,计算机会给你换算成bootstrap值。重排的序列有很多组合,值越小说明分枝的可信度越低,最好根据数据的情况选用不同的构树方法和模型.
9楼2014-07-03 09:29:01
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yananhl

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
顶一下,以后我可能会用到,不过现在不会。。
3楼2012-08-06 10:53:47
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雪强爱信

新虫 (初入文坛)

我也想洗耳恭听
4楼2012-08-06 10:56:54
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ghs25372216

禁虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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5楼2012-08-06 11:15:55
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