24小时热门版块排行榜    

查看: 3136  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

夏日小黄瓜

金虫 (初入文坛)

[求助] 以酵母基因组为模板进行PCR扩增没有条带

实验室有三株构建好的毕赤酵母工程菌
都带有我需要的目的基因(大小约为2kb)
我用酵母基因组提取试剂盒分别提取了三者的基因组
用目的基因的上下游引物进行PCR扩增
使用的是Taq酶(想要先确保能够扩增出来再使用高保真酶)
预变性94℃×5min
变性94℃×30s
退火55℃×30s
延伸72℃×2min
补延伸72℃×10min
4℃∞
30个循环
其中只有一种酵母基因组扩增出了我要的条带
但是测序表明有很多点突变和碱基缺失
后来我改变退火温度51,53,55,57,59都试过
每次都带有P得出结果的那个基因组做对照
还是没条带
我想请教一下:
1.如何能从另两种酵母基因组扩增出条带?
2.就算扩增出条带,能够保证测序正确么?为什么穿梭质粒构建好了也测序正确的,重组到酵母基因组中之后再次扩增目的基因会有这么多的缺失和点突变呢?如果缺失和突变不能避免,那么用酵母基因组作为模板可靠吗?
多谢!!!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caoluoyuan

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你的目的片段与酵母基因组相似性多高?你扩增出来的片段很有可能不是你目的片段,而是酵母基因组自有的片段。
3楼2012-07-04 17:01:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

夏日小黄瓜

金虫 (初入文坛)

麻烦大家帮忙出点主意吧
一个头两个大了。。。
2楼2012-07-04 16:05:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夏日小黄瓜

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by caoluoyuan at 2012-07-04 17:01:01
你的目的片段与酵母基因组相似性多高?你扩增出来的片段很有可能不是你目的片段,而是酵母基因组自有的片段。

因为三种酵母基因组中已经整合进的片段也就是我需要的片段是人源的
我的引物就是目的基因片段的上下游片段
扩增出来的那一个测序过 有缺失和突变 但是大部分还算是目的基因片段
只是想不通为什么另外两种酵母基因组P不出来。。。
谢谢!
4楼2012-07-05 09:10:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

满桌儿

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
突变可能是你用的模板质粒浓度太大了,稀释1000,5000,10000倍看看,只要能出较亮的带就行,循环数30够了。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2012-07-05 23:41:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料专业求调剂 +5 hanamiko 2026-03-18 5/250 2026-03-18 20:19 by 星空星月
[考研] 求材料调剂 +7 隔壁陈先生 2026-03-12 7/350 2026-03-18 16:14 by 枫桥ZL
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 9/450 2026-03-18 15:31 by vgtyfty
[考研] 266求调剂 +5 阳阳哇塞 2026-03-14 9/450 2026-03-18 15:05 by stone_128
[考研] 材料专硕306英一数二 +10 z1z2z3879 2026-03-16 13/650 2026-03-18 14:20 by 007_lilei
[考研] 0703化学调剂 ,六级已过,有科研经历 +10 曦熙兮 2026-03-15 10/500 2026-03-18 14:19 by 007_lilei
[考研] 280求调剂 +6 咕噜晓晓 2026-03-18 7/350 2026-03-18 11:25 by 无际的草原
[考研] 268求调剂 +7 好运连绵不绝 2026-03-12 8/400 2026-03-17 20:28 by xilongliang
[考研] 277调剂 +5 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-17 19:26 by 李leezz
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +16 不知道叫什么! 2026-03-15 18/900 2026-03-17 17:05 by ruiyingmiao
[考研] 【0856】化学工程(085602)313 分,本科学科评估A类院校化学工程与工艺,诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 8/400 2026-03-17 16:57 by ruiyingmiao
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +8 一鸭鸭哟 2026-03-14 10/500 2026-03-17 15:07 by 一鸭鸭哟
[考研] 一志愿苏州大学材料工程(085601)专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +6 大火山小火山 2026-03-16 8/400 2026-03-17 15:05 by 无懈可击111
[考研] 材料工程专硕274一志愿211求调剂 +6 薛云鹏 2026-03-15 6/300 2026-03-17 11:05 by 学员h26Tkc
[考研] 285化工学硕求调剂(081700) +9 柴郡猫_ 2026-03-12 9/450 2026-03-17 10:18 by Sammy2
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 0856专硕279求调剂 +5 加油加油!? 2026-03-15 5/250 2026-03-15 11:58 by 2020015
[考研] 中科大材料专硕319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-13 3/150 2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 297一志愿上交085600求调剂 +5 指尖八千里 2026-03-14 5/250 2026-03-14 17:26 by a不易
信息提示
请填处理意见