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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于EST载体序列去除
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cai3110274

木虫 (职业作家)

[求助] 关于EST载体序列去除

请问有没有什么工具可以批量去除EST载体序列
要能直接生成去除之后的文件的
最好也能去除低质量序列
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夫天地者万物之逆旅
1楼 2012-06-06 07:57:00
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gungunak47

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我知道有个叫 cross_match
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2楼2012-06-13 17:49:36
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luck_cc

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

有的，屏蔽序列中的载体序列的软件：crossmatch  
基本用法：cross_match  序列文件  载体序列 –screen >screen.out
不过这个用法是在linux系统下用的，不知道楼主是不是这样用的？
赞一下 回复此楼
认真目标，勇往直前
3楼2013-01-06 19:38:54
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