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egogg

木虫 (小有名气)

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[求助] NEB 结果分析

过渡态方面我是一个新手，求教一下NEB的结果如何分析：
CI-NEB的脚本给出了如下的反应路径，该如何分析？

反应过程的动画跟我想象的差不多，还需要做些什么工作？
非常感谢！

[ Last edited by egogg on 2012-5-15 at 15:15 ]

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1楼 2012-05-15 15:11:53

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

cavediger

金虫 (正式写手)

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贺仪: 金币+3, 谢谢指教！ 2012-05-21 08:17:12

引用回帖:

6楼: Originally posted by egogg at 2012-05-20 11:48:50:
明白了，非常感谢。

也就是说需要进行一次频率验证就行了。

但是能不能指点一下，为什么说03的结构是过渡态，这个图显示的不是04为最高峰么？还有就是如果00有些像前过渡态的话，我能不能从01或02开始重新 ...

1.但是能不能指点一下，为什么说03的结构是过渡态，这个图显示的不是04为最高峰么？
我以为你的第一个点是00，如果不是，就按你的次序后推，总之，能量最高者可能是TS
2.还有就是如果00有些像前过渡态的话，我能不能从01或02开始重新作NEB计算？
00里是反应物，不会像过渡态吧。找TS是在反应物和产物间搜索的，一般用CNEB在中间插若干点，找TS命中率还是蛮高的。也有人采用逐步逼近的办法，譬如每次插入3个点，待NEB收敛后，根据情况，将两个端点向内收缩，减小TS所在的区间，反复多次，当有TS区间收缩到足够小时，认为得到了TS，不过，这样做显得比较麻烦，用的人很少。
3.将IBRION=5直接做频率计算，具体细节在参考一下手册吧