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egogg

木虫 (小有名气)

[求助] NEB 结果分析

过渡态方面我是一个新手,求教一下NEB的结果如何分析:
CI-NEB的脚本给出了如下的反应路径,该如何分析?

反应过程的动画跟我想象的差不多,还需要做些什么工作?
非常感谢!

[ Last edited by egogg on 2012-5-15 at 15:15 ]
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egogg

木虫 (小有名气)

来个有经验的人啊,自己再顶顶。
4楼2012-05-16 12:58:35
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查看全部 13 个回答

xiongb123456

铜虫 (小有名气)

帮你顶一个 我也想知道!!
LZ知道了 告诉下我呗 谢谢
3楼2012-05-15 17:04:36
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hakuna

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
liliangfang: 金币+1, 谢谢指教 2012-05-20 08:41:07
egogg: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-05-20 11:49:29
这个告诉你03下的结构可能是TS,可以对这个结构做一下频率计算,已确认是否真的是TS,如果是,你可以求出能垒(00与03能量差)以及这个过程的能量变化(00与07能量差)。另外,TS结构更像00,说是前过渡态的话,有点勉强。
如果你做的图是正确的话!
其它似乎没什么要说的了
5楼2012-05-19 21:28:16
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egogg

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by hakuna at 2012-05-19 21:28:16:
这个告诉你03下的结构可能是TS,可以对这个结构做一下频率计算,已确认是否真的是TS,如果是,你可以求出能垒(00与03能量差)以及这个过程的能量变化(00与07能量差)。另外,TS结构更像00,说是前过渡态的话,有 ...

明白了,非常感谢。

也就是说需要进行一次频率验证就行了。

但是能不能指点一下,为什么说03的结构是过渡态,这个图显示的不是04为最高峰么?还有就是如果00有些像前过渡态的话,我能不能从01或02开始重新作NEB计算?因为就像您说的那样,从反应的动画来看,00和后面的差很远(相关性很差,我取初始态的时候取得离我想研究的反应路径远有些远了)。

还有就是做频率验证用vasp自带的算算Gamma点就行,还是用vstool的官方网站上介绍的Dynamical Matrix方法比较好一点,非常感谢!
6楼2012-05-20 11:48:50
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