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tingspdf

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 定量PCR读取荧光值的步骤需要保持多长时间?

各位朋友好!最近做定量PCR遇到了点问题,仪器是ABI7300,在延伸步骤读取荧光值会有非特征峰,所以想在后面加一步高温步骤(约80-85度)读取荧光值,想问一下通常这一步需要保持多长时间?谢谢!
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tingspdf

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 西瓜 at 2012-05-09 21:21:18:
这样是不行的哦。有非特异峰就代表有非特异扩增,如果你是两步法(退火、延伸用同一个温度),可以改为传统的三步法以增加特异性。也可以尝试提高退火温度。
如果你用的荧光染料是sybr green,只能在延伸结束时检 ...

版主您好,我用的确实是SYBR green, 三步法的结果不太理想,标线斜率-2.22...相当于极其高的扩增效率,遂改成两步法在实验,我们周围有加一步专门检测荧光的步骤,效果还不错,呵呵,所以才在此询问一下各位。
6楼2012-05-12 14:53:45
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查看全部 13 个回答

cheng_xiao

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-09 13:55:14
tingspdf: 金币+2 2012-05-12 14:51:15
我觉得按照你实验的步骤设计吗,30s就行啊,或者短一点,15s左右,这一步只是读数据,关键还是你设计的温度,从溶解曲线可以看出你温度越高,值就越小这是一定的,所以温度是很重要的。实验顺利啊
我努力我奋斗我成功
2楼2012-05-09 10:44:25
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 斑斑很辛苦哈 2012-05-10 13:40:22
tingspdf: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-05-12 14:56:12
这样是不行的哦。有非特异峰就代表有非特异扩增,如果你是两步法(退火、延伸用同一个温度),可以改为传统的三步法以增加特异性。也可以尝试提高退火温度。
如果你用的荧光染料是sybr green,只能在延伸结束时检测荧光信号,额外增加一个专门检测荧光的步骤是不可行的哦。
3楼2012-05-09 21:21:18
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

★ ★
西瓜: 金币+2, 学习了哈~ 2012-05-10 03:59:58
引用回帖:
3楼: Originally posted by 西瓜 at 2012-05-09 21:21:18:
这样是不行的哦。有非特异峰就代表有非特异扩增,如果你是两步法(退火、延伸用同一个温度),可以改为传统的三步法以增加特异性。也可以尝试提高退火温度。
如果你用的荧光染料是sybr green,只能在延伸结束时检 ...

西瓜大哥哦
有非特异峰值还有可能是管子的问题哦 我们经常遇到的 有些公司的96孔板会有非特异性扩增 换成好些的8-strips tube就没啥问题了
Let God do with it as He wills
4楼2012-05-09 23:48:17
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