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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 细菌基因组DNA的提取问题
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蛋白之家

新虫 (小有名气)

[交流] 细菌基因组DNA的提取问题

我使用的菌株是欧文式菌，提出来的基因组DNA是这样的（下图）
是4个不同的菌株的DNA   不知道是不是  
麻烦大家给予宝贵意见
谢谢

细菌染色体DNA
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1楼 2012-04-19 17:06:23
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to-be

金虫 (正式写手)
★ ★
蛋白之家(金币+1): 谢谢参与
西瓜: 金币+1, 鼓励交流 2012-04-23 18:39:36
Marker呢？通过大小可以帮助判断。
同时好多条带啊，我见过的细菌基因组应该是很大一条带，提的如不好会有大拖尾。
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2楼2012-04-19 18:27:00
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kabuqinuo89

新虫 (小有名气)
★
蛋白之家(金币+1): 谢谢参与
怎么连个marker也没有，有可能基因组DNA断了，在提的时候要小心一些，摇匀时动作要轻些
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3楼2012-04-19 18:49:17
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xiaoyang123

金虫 (小有名气)
★
蛋白之家(金币+1): 谢谢参与
你提的是总DNA么。最上面的那条带是基因组DNA，下面的三条带应该是菌中所携带的质粒。可以查询一下菌株信息，看里头是否带有质粒。
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4楼2012-04-19 18:55:13
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madengyu

禁虫 (小有名气)
★
蛋白之家(金币+1): 谢谢参与
送鲜花一朵
本帖内容被屏蔽
5楼2012-04-19 19:17:21
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piggpi

金虫 (小有名气)
★
蛋白之家(金币+1): 谢谢参与
4个菌株能跑出一致的胶图，挺奇怪的。
不知道楼主提取步骤是什么，用试剂盒吗？
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6楼2012-04-19 21:33:16
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我是小纯洁

金虫 (正式写手)
★
蛋白之家(金币+1): 谢谢参与
我们实验室是做pcc的，不知道你们实验室做什么的啊？
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7楼2012-04-20 00:03:02
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)
★ ★ ★ ★
蛋白之家(金币+1): 谢谢参与
西瓜: 金币+3, 鼓励交流！呵呵，报上专业了啊，以后有相关帖子就@你，哈哈~ 2012-04-23 18:40:50
同种细菌的基因组应该是分子量比较接近的，除非断裂或者降解，不会拖尾。四种菌株带型这样整齐，不好说，也可能彼此基因组的大小接近。但是没有Marker还是操作不正确，有Marker，那是质粒，哪是基因组DNA一目了然。呵呵呵。。。我现在是搞生物大分子的结构、功能、自作装（包括蛋白质折叠）、相互作用复杂网络的，偏重于蛋白质，好久没有自己提DNA了。
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8楼2012-04-20 00:32:33
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wangying16a

银虫 (小有名气)
★
蛋白之家(金币+1): 谢谢参与
基因组应该有断裂，还有下面的条带如果是RNA的话，是不是应该只有一条带啊，它有两条带啊
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9楼2012-04-20 08:39:22
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dovekaoyan

木虫 (正式写手)
★ ★
蛋白之家(金币+1): 谢谢参与
西瓜: 金币+1, 鼓励 2012-04-23 18:41:24
应该是一条较宽的条带，这个像是RNA的电泳图，呵呵，肯定你的DNA裂解了
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10楼2012-04-20 09:45:07
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chenzhenwei0

铜虫 (小有名气)
★
蛋白之家(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
4楼: Originally posted by xiaoyang123 at 2012-04-19 18:55:13:
你提的是总DNA么。最上面的那条带是基因组DNA，下面的三条带应该是菌中所携带的质粒。可以查询一下菌株信息，看里头是否带有质粒。

您好 普通的提取DNA方法质粒能提出来么 我做的重组菌提DNA跑电泳没有看到我的质粒带 是不是我没有提好呢
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11楼2012-04-20 14:59:09
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我是小纯洁

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
11楼: Originally posted by chenzhenwei0 at 2012-04-20 14:59:09:
您好 普通的提取DNA方法质粒能提出来么 我做的重组菌提DNA跑电泳没有看到我的质粒带 是不是我没有提好呢

要是有的话肯定能提取出来，你要是不放心，可以用质粒小提试剂盒检测有没有质粒。
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12楼2012-04-22 19:52:49
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dehong1573

至尊木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by madengyu at 2012-04-19 19:17:21:
下面两条好像是RNA吧，好像含有RNA。

不会是RNA吧，抽总DNA都有这么好质量的RNA，让我们抽RNA老降解的人情以何堪啊!
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13楼2012-04-22 20:01:10
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dehong1573

至尊木虫 (正式写手)
应该是质粒
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14楼2012-04-22 20:02:02
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蛋白之家

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by piggpi at 2012-04-19 21:33:16:
4个菌株能跑出一致的胶图，挺奇怪的。
不知道楼主提取步骤是什么，用试剂盒吗？

手提的  哪有什么试剂盒   二导给的方法提的DNA  他自己是没有做过  不知道在哪弄的方法
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15楼2012-04-23 16:07:58
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天使托

专家顾问 (职业作家)
基因组好像只有一条带吧？
而且你应该根据你点的marker来判断吧。。。
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16楼2012-04-23 22:45:51
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piggpi

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
15楼: Originally posted by 蛋白之家 at 2012-04-23 16:07:58:
手提的  哪有什么试剂盒   二导给的方法提的DNA  他自己是没有做过  不知道在哪弄的方法

存在RNA的可能性，看看加RNA酶没有
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17楼2012-04-23 23:28:42
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蛋白之家

新虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by piggpi at 2012-04-23 23:28:42:
存在RNA的可能性，看看加RNA酶没有

没加RNA酶  我们二导说是不用加     我现在很不相信我这个二导了
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18楼2012-04-26 11:28:39
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