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xiazhiwuxie

银虫 (小有名气)

[求助] 大片段连接问题

实验室得到一个片段为2300bp左右的DNA序列,但是连接了半个月都没有连上,连接体系是:19T 0.5ul
            目的条带 5ul
           solution I  5ul
       过夜4度,16度连接3h
   也做过16度连接两夜
    做过4度
  期间确定目的条带回收正确,连接体系也用了最新的,感受态是买的,在这个条带的靠近3‘端约200bp是已知的,根据这个片段设计引物,扩增约为140bp。
  得到的结果:1.不长菌
              2.长菌,但是扩增无条带
              3.长菌,扩增出140bp,但是测序后,结果告知插入片段只有200bp,且这200bp片段就是已知部分,抽了质粒后得知条带大约就是比2000bp的大点。

我快疯了,折腾了半个月,序列还没得到,求高人指导!
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

【答案】应助回帖

★ ★
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小丹木木: 金币+2, 专家考核 2012-04-16 13:55:31
酶切连接不光看你的条带有多大,而是看你的载体和目的片段的相对浓度。。。设计好一个连接体系。。。然后就是转化的问题了。。。
当然,个人认为还是连接这一步比较重要。。。尤其是你上一步的酶切纯化是否干净,如果不干净,那么直接影响后期的连接。。。。
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
6楼2012-04-15 21:41:25
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