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荧光pcr标准曲线问题
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yangzhengnan
新虫
(初入文坛)
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(幼儿园)
金币: 59
帖子: 4
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虫号: 909093
注册: 2009-11-21
性别: GG
专业: 女性生殖系统肿瘤
[
求助
]
荧光pcr标准曲线问题
今天做了一条标准曲线,很奇怪,目的基因模板按2倍稀释,但是ct值却相差很小,复孔之间的差别很大,但内参复孔间的差别很小,不知各位大侠可不可以给点建议呢?到底是哪里出了问题?
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1楼
2012-04-05 17:33:51
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若水5886
新虫
(小有名气)
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应助: 46
(小学生)
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散金: 140
帖子: 218
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虫号: 707846
注册: 2009-02-24
专业: 蛋白质组学
【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
首先要确定你的程序跑出来的条带比较单一,特异性好,不然定量结果没有意义;
其次标线一般做10倍倍比稀释,一定要充分震荡混匀,取样到下一个梯度时要用枪头尖贴着管壁吸取,这样枪头上沾的会比较少;
最后加样的时候一定要把枪头插入液面以下,在液体和空气接触面稍微下一点就可以。
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6楼
2012-04-06 14:46:20
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atlanticwi
金虫
(正式写手)
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应助: 138
(高中生)
金币: 141.2
散金: 350
红花: 13
帖子: 536
在线: 313.2小时
虫号: 1099992
注册: 2010-09-15
专业: 植物生理与生化
【答案】应助回帖
★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西瓜: 金币+2, 2倍确实太小
2012-04-05 18:43:54
有图有真相
复孔指的技术重复吗?如果是的,注意加样误差,甩出来一丁点都会影响Ct值,同样注意机子可能有加热不匀的情况
为何做2倍稀释呢,太小了吧,稀释10倍看看吧
个人经验,若有说错,高手指点哦
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Let God do with it as He wills
2楼
2012-04-05 17:38:21
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孙启亮
金虫
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虫号: 1112263
注册: 2010-10-01
性别: GG
专业: 前寒武纪地质学
【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
跟我遇到的问题一样,多做几次吧。有可能是基因丰度太低,所以你稀释的不均匀可能是主要原因。因为内参的丰度高,所以你操作的影响不大,但是目的基因就不一样了
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3楼
2012-04-05 18:35:57
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西瓜
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虫号: 271749
注册: 2006-08-13
性别: GG
专业: 细胞衰老
管辖:
分子生物
【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
理想情况下扩增效率为100%,产物按2的N次方递增,如果模板量相差8倍,Ct值也就相差3而已(2^3=8),所以你的2倍梯度,Ct值也就相差1左右。一般做标准曲线取10倍梯度比较常见哦。
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4楼
2012-04-05 18:45:51
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