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805085868

铁虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 75.4
帖子: 92
在线: 26.5小时
虫号: 1393000

[交流] 求基因敲除高手。。。。

我基因敲除用的方法是同源重组，设计的上游同源臂测序之后发现有个别位点突变，请问影响基因敲除实验吗？会不会影响上游基因的表达？（上游基因的ORF与下游基因的ORF方向相同。）

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1楼 2012-03-31 21:25:40

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sisy_shaw

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 28
帖子: 11
在线: 1.1小时
虫号: 1626570

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

我也遇见了同样的问题，上下游同源臂都有好几个碱基的错配，不是到lz大人是怎么办的呢？求助~~~

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7楼2012-08-13 15:45:51

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lincy2010

银虫 (小有名气)

MolEPI: 3
应助: 11 (小学生)
金币: 530.4
帖子: 72
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虫号: 1066511

★ ★ ★ ★
805085868(金币+1): 谢谢参与
西瓜: 金币+3, 回复很耐心啊~愚人节快乐O(∩_∩)O 2012-04-01 17:43:00

首先想问你测序的方式是什么？PCR产物直接测还是连到载体上再测？测的是双向还是单向？因为这些会影响测序结果的可信度。
其次，“个别位点突变”指的是只突变一个吗？如果同源臂较长，估计是不影响重组实验，但突变的位点会不会在重组体中那就不一定了，有机率在，也有机率不在。可以PCR包含上游同源臂的片断测序验证。
再次，如果筛选到的都有这个突变位点，会不会影响基因表达，要看突变的处于哪个位置。若在翻译区，会不会造成移码突变，若只是换了碱基，看蛋白序列改变了没；若在非翻译区，还在看是否改了启动子RBS等等，大概就是这样吧，说的不对的，请大家指正哈~
愚人节快乐，不得不说小木虫太有才啦^-^

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3楼2012-04-01 01:40:52

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