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dzwd

金虫 (小有名气)

[求助] tail-PCR问题,求指导

第一次做有特异条带。同一条件,重复了两次都没有特异条带。是操作问题吗?应该在哪方面改进?高手指点下吧
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
西瓜: 金币+5, MolEPI+1, 有条有理~普通PCR重复性是不错,tail-PCR有时候真就看人品。。 2012-03-25 16:13:49
dzwd: 金币+4, ★★★★★最佳答案, 谢谢啊 2012-03-25 21:57:38
嗯.......
不是说没有原因,而是你这种情况,原因可能太多,我们一般认为如果能做出来一次,就说明体系和程序是木有问题的,重复不出来的话,我们会考虑:
    1. 引物降解、dNTP降解等,所以会把体系都换一遍
    2. 模板也降解,重新提取后再做
    3. 机子最近出了问题,换别人的机子试试
    4. TAIL-PCR本来一次时间就要3-4个小时、如果你第一轮扩增时间过长,酶能不能抗住也还是问题呢
    5. 实在不行,就回去暴吃一顿、蒙头睡一觉,心情好些再继续
PCR本来就是概率时间,就算什么都优化了完美了,也不一定100%重复出来哦
Let God do with it as He wills
6楼2012-03-25 09:12:27
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普通回帖

atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气


西瓜: 金币+1, 鼓励交流!PCR是很神奇…… 2012-03-25 16:12:20
呵呵呵呵呵呵
同一条件,重复不出来,很正常啊,你需要考虑人品、机子、样品降解等各种因素哦,把所有能换的东西都换成新的,再P一下 P不出来的话,回去睡一觉,休息两三天,默默攒点人品,就会出来了,嘿嘿
Let God do with it as He wills
2楼2012-03-24 19:32:22
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wocooo

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你这第一次是指的什么 第一轮扩增?
3楼2012-03-24 23:38:06
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dzwd

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wocooo at 2012-03-24 23:38:06:
你这第一次是指的什么 第一轮扩增?

不是,是第一次做。第一次完整PCR之后,发现有条带。重复两次后发现没有了。
4楼2012-03-25 08:34:20
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dzwd

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by atlanticwi at 2012-03-24 19:32:22:
呵呵呵呵呵呵
同一条件,重复不出来,很正常啊,你需要考虑人品、机子、样品降解等各种因素哦,把所有能换的东西都换成新的,再P一下 P不出来的话,回去睡一觉,休息两三天,默默攒点人品,就会出来了,嘿嘿

没有原因的吗?
5楼2012-03-25 08:34:54
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
dzwd: 金币+3, ★★★很有帮助 2012-03-25 21:58:01
很正常,TAIL-PCR有时靠运气,
jiayoubashaonian
7楼2012-03-25 11:36:23
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aoaoshch

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
多加点模板DNA试试吧。换别的随机引物试试,TaKaRa的比较好用。TAIL有时候就要运气的。把你的PCR产物保存好,以备下轮使用。GOOD LUCK !
8楼2012-03-26 21:45:21
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zgb1982

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个真是不好说原因,也有的前几次都出不来,重复几次就出来了,没有为什么啊。说不定是你后两轮的模板稀释的不够多
9楼2012-03-26 22:49:12
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caidan1385

新虫 (初入文坛)

请问你做Tail-PCR时,3~4个简并引物是混合在一起与左臂或右臂特异性引物进行pcr反应的还是每个简并引物都要与左臂或右臂特异性引物单独反应啊?求指点下,谢谢了
10楼2012-05-23 12:53:30
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