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cfmzxf84木虫 (正式写手)
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[求助]
求助，已有PDB结构的DS同源建模步骤，谢谢
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求助，我想用DS同源建模，已有多个PDB模板可以用，请教怎么操作呢？ 网上的教程基本上都是需要n95，或者90数据库，从网上download结构。 我有自己的模版，因此改变了一些步骤来做，但是一直不成功，求指导。谢谢 |
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4楼2012-03-18 08:10:05
【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+3, 鼓励交流 2012-03-17 19:49:58
cfmzxf84: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢 2012-03-18 00:16:03
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cfmzxf84: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢 2012-03-18 00:16:03
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首先把你要建模的目标序列编译成fasta文件 然后打开编好的fasta文件接着打开你要当做模板的pdb文件 接下来在protocol里找到align sequence to template模块，分别放入你的序列文件和pdb文件，修改相应参数 计算完成后打开运行结果然后运行build homology modle放入相应的文件进行运算就ok了。 |
2楼2012-03-17 19:43:10
cfmzxf84
木虫 (正式写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
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- 在线: 328.6小时
- 虫号: 814536
- 注册: 2009-07-23
- 专业: 化学环境污染与健康
3楼2012-03-18 00:17:52
cfmzxf84
木虫 (正式写手)
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5楼2012-03-18 09:09:40
