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[交流] 氨基酸与锌的亲和力问题

帮朋友请教一个问题。

请问各位大侠。
哪些氨基酸与过渡金属锌的亲和力最强呢?

谢谢。

[ 来自科研家族 生物医药家族 ]
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痴夷子皮(金币+4): 有帮助,谢谢。 2012-03-09 16:32:51
痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:40:53
痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:42:52
这个单从氨基酸这点上考虑应该是看电荷的,带的负电荷越多,与阳离子结合能力越强。但是从蛋白角度来考虑,就要考虑接触面整体带电情况了。可以看看锌指结构方面的文献。


祝实验顺利
4楼2012-03-09 09:28:28
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普通回帖
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痴夷子皮(金币+1): 打扰了,不好意思。还是谢谢哈。 2012-03-08 23:40:20
痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:40:47
不懂,帮顶~~
2楼2012-03-08 23:36:39
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痴夷子皮(金币+1): 打扰了,不好意思。依然感谢哈 2012-03-09 08:12:29
痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:40:51
晕过,不懂,不好意思。
3楼2012-03-09 02:37:30
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yabxxh

木虫 (正式写手)


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痴夷子皮(金币+3): 有帮助,谢谢。 2012-03-09 16:33:11
痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:41:00
痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:42:58
同意楼上的说法,其实感觉应该可以从结构上入手,不过我的生物化学当年学的很烂,呵呵
5楼2012-03-09 10:26:09
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落满夏天

银虫 (正式写手)


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痴夷子皮(金币+4): 有帮助,谢谢。 2012-03-09 16:33:30
痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:41:05
呵呵,很多氨基酸都可以和过渡金属离子螯合,有氨基和羧基,金属离子有空电子轨道的话就可以配位.楼主的这个问题我遇见过,但是所知也不甚详,这个跟结构有关系.比如GLY和铜离子的配位就比铁的配位强,his配位后可能比甘氨酸还牢固.有机会研究研究下.
6楼2012-03-09 15:54:04
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asznpb

木虫 (正式写手)


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痴夷子皮(金币+4): 有帮助,谢谢。 2012-03-09 16:34:03
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痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:42:24
锌作为酶的辅基因子出现,或者和辅酶螯合在一起,锌指蛋白神马的,建议找本无机生物化学瞅瞅呗,挺多的这一类,蛋白质结构,构象神马的一想起来就晕&……
7楼2012-03-09 16:29:16
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liudt1105

铜虫 (小有名气)


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痴夷子皮: 金币+4, 谢谢。 2012-03-16 11:20:47
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痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:42:28
六楼说的是有道理的,不过纠正一点,一般与锌离子结合的都是蛋白质利用空间结构和所带电荷与Zn离子螯合。如果你研究锌类保健品,应该多考虑一下蛋白质方面。
从常理考虑氨基酸上面应该可以水解出的负离子越多越可以吸附锌
8楼2012-03-09 19:07:33
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vinn87

新虫 (初入文坛)


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痴夷子皮: 金币+1, 谢谢支持。 2012-03-16 11:22:17
痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:41:15
你做的是氨基酸螯合锌么?
9楼2012-03-09 21:15:40
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痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:41:20
…………………………………………………………………………………………………………………………………………
10楼2012-03-09 21:20:33
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引用回帖:
9楼: Originally posted by vinn87 at 2012-03-09 21:15:40:
你做的是氨基酸螯合锌么?

不是,帮朋友问的,这方面我不懂,呵呵
11楼2012-03-09 21:27:13
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落满夏天

银虫 (正式写手)


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痴夷子皮: 金币+4, 谢谢。 2012-03-16 11:21:34
痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:41:27
有些氨基酸本身没有紫外吸收,但是与金属离子配位后有紫外吸收,这个也需要注意,现在这些技术有的已经用于饲料了,呵呵.金属离子与酶类的东西个人理解和氨基酸与金属离子还不一样.因为金属离子对酶类起的是一个激活作用,没有金属离子的参与,很多酶类是没有活性的.激活原理饿哦没有研究过,也许是电子的得失变化,楼主可以研究.祝好运.
12楼2012-03-12 15:54:26
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13楼: Originally posted by jacy_cheyn at 2012-03-26 10:14:35:
GSH

被你发现了。。。。
14楼2012-03-26 10:22:27
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jacy_cheyn

铁杆木虫 (知名作家)


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痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:41:36
引用回帖:
14楼: Originally posted by 痴夷子皮 at 2012-03-26 10:22:27:
被你发现了。。。。

啥意思
15楼2012-03-27 08:33:51
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15楼: Originally posted by jacy_cheyn at 2012-03-27 08:33:51:
啥意思

= =
没啥意思啊。
居然在这里碰到你。。。
16楼2012-03-27 08:34:50
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jacy_cheyn

铁杆木虫 (知名作家)


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痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:41:41
引用回帖:
16楼: Originally posted by 痴夷子皮 at 2012-03-27 08:34:50:
= =
没啥意思啊。
居然在这里碰到你。。。

我看到是你的帖子,就回复已你下,用GSH是可以的
17楼2012-03-27 08:38:00
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引用回帖:
17楼: Originally posted by jacy_cheyn at 2012-03-27 08:38:00:
我看到是你的帖子,就回复已你下,用GSH是可以的

没反应过来,现在知道什么意思了,谢谢哈。
18楼2012-03-27 08:39:22
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jacy_cheyn

铁杆木虫 (知名作家)


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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:41:46
引用回帖:
18楼: Originally posted by 痴夷子皮 at 2012-03-27 08:39:22:
没反应过来,现在知道什么意思了,谢谢哈。

败给你了……现在知道了吧~
19楼2012-03-28 14:12:45
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19楼: Originally posted by jacy_cheyn at 2012-03-28 14:12:45:
败给你了……现在知道了吧~

知道了。。。。嘿嘿
20楼2012-03-28 14:17:31
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jacy_cheyn

铁杆木虫 (知名作家)


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痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:42:01
引用回帖:
20楼: Originally posted by 痴夷子皮 at 2012-03-28 14:17:31:
知道了。。。。嘿嘿

你的专业怎么是无神论……?
21楼2012-03-28 15:06:06
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引用回帖:
21楼: Originally posted by jacy_cheyn at 2012-03-28 15:06:06:
你的专业怎么是无神论……?

因为比较拉风
22楼2012-03-28 15:16:29
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jacy_cheyn

铁杆木虫 (知名作家)


引用回帖:
22楼: Originally posted by 痴夷子皮 at 2012-03-28 15:16:29:
因为比较拉风

SO it is
23楼2012-03-28 15:20:22
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miaoxiangzhi

银虫 (初入文坛)


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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
17楼: Originally posted by jacy_cheyn at 2012-03-27 08:38:00
我看到是你的帖子,就回复已你下,用GSH是可以的...

请问大侠 能否讲下 用GSH是可以的 是什么意思 我现在实验也遇到同样的问题 需要将金属离子螯合掉然后测酶活
24楼2013-04-21 16:24:04
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我根据我在分子生物版回答的一帖补充一下这个问题。
“很多氨基酸都可以和过渡金属离子螯合,有氨基和羧基,金属离子有空电子轨道的话就可以配位.”这是没有错的。

确定配位键的大小,以及怎样除去含金属的蛋白质的中的锌离子的方法可以参考:
1.根据配位化学原理:与一个同样的金属原子或离子(在配合物种两者都叫中心原子)形成配位键越多的化合物一般一旦与该金属原子或离子形成了螯合物会越稳定;
2.蛋白质性形后,失去空间保护的蛋白质螯合物中的金属原子或离子会更容易拆解下来。
3.任何螯合物(包括锌指蛋白)都是处于动态平衡状态,所以螯合物中的配位键结合的金属原子或离子(在配合物种两者都叫中心原子)都不是永远呆在螯合物(包括锌指蛋白),所以锌指蛋白质可能在(至少理论上)生理条件下失去锌离子而稳定存在。但是如果重新表达无锌离子的锌指蛋白会不会形成天然蛋白,我不清楚,因为蛋白质折叠的影响因素很多,在细胞内至少还要考虑分子拥挤和折叠酶及分子伴侣的因素,还有我现在并不清楚在细胞内的锌指蛋白的锌离子是不是在其他蛋白质和酶作用下接上去的。因此,不建议重现表达,而建议直接使用竞争性螯合试剂去除锌指蛋白的锌离子。
根据第一条原理可以使用用冠醚(大环多元醚)、咕啉等伸向螯合物中的配位键结合的金属原子或离子(在配合物种两者都叫中心原子)的齿(配位键)比较多的化合物来竞争夺取锌指蛋白的锌离子,而后用超滤或者透析方法去除掉有机螯合物。

另外,还可以在溶液中加入冠醚、咕啉、EDTA等能与金属形成螯合物的有机物的情况下,通入少量的电流,比照蛋白质电泳的电流、电压的10%以下的值,改变溶液的氧化还原环境也会有利于去掉锌指蛋白的锌原子;之前可加入变性剂对蛋白质变性,暴露出锌指蛋白的锌原子的结合位点;而后透析或者超滤去掉变性剂和螯合上从锌指蛋白抢夺到的锌原子的能与金属形成螯合物的有机物,这样应该至少可以获得一些无锌原子的锌指蛋白。

不过直接电泳企图获得无锌离子的锌指蛋白不大可能,因为很难对电泳的样品复性,就算能够复性,没有其他的冠醚、咕啉、EDTA等能与金属形成螯合物的有机物的情况下,被氧化或者出来的锌离子的行为也很难预测。因此,我不建议如此,还有上面所说的蛋白质变性不要用热变性,因为一般无法恢复天然态,可以用酸碱变性或者盐酸胍或尿素变性,至少去除变性剂后能够有些蛋白质复性。

配位化学:
https://ishare.iask.sina.com.cn/f/20547086.html?from=like
25楼2013-04-21 16:45:40
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一般来还是蛋白质中的组氨酸和半胱氨酸与锌离子的结合力最强。
26楼2013-04-21 16:47:30
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jacy_cheyn

铁杆木虫 (知名作家)


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引用回帖:
24楼: Originally posted by miaoxiangzhi at 2013-04-21 16:24:04
请问大侠 能否讲下 用GSH是可以的 是什么意思 我现在实验也遇到同样的问题 需要将金属离子螯合掉然后测酶活
...

我不是做生物的,呵呵,对这个没有研究过~不好意思帮不上忙
27楼2013-04-23 10:19:44
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Hm.AQ

新虫 (初入文坛)


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引用回帖:
26楼: Originally posted by 凌波丽 at 2013-04-21 16:47:30
一般来还是蛋白质中的组氨酸和半胱氨酸与锌离子的结合力最强。

其实啊,这个亲和能力可以用稳定常数来表示,一个配体与中心原子的配合物越稳定,稳定常数越大,则我们可以说这个配体与中心原子亲和力较强。
   而比较各种氨基酸与金属锌的亲和力大小,可以用软硬酸碱原则来解释,软软结合更强,大多数过渡金属为软酸,那么氨基酸中若有巯基等为软碱的R侧基,那么就比较容易与金属形成稳定常数大的螯合物
28楼2013-12-10 21:38:31
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salyting

禁虫 (初入文坛)

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29楼2014-09-16 20:16:13
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jacy_cheyn13楼
2012-03-26 10:14   回复  
痴夷子皮: 金币+5, 谢谢哈。 2012-03-27 08:39:38
痴夷子皮: 金币+1 2012-05-05 00:41:32
GSH
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