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阿博小硕士

铜虫 (小有名气)

[求助] 分子生物学高手进

谁能帮我看看,这是个什么菌?以下是菌种的全序列。
CCGAATGCGCTGCTATCATGCAGTCGAACGGGATTCATTTTAAGCTTGCTTAAGATGATGAGAGTGGCGCACGGGTGCGTAACGCGTGAGCAACCTGCCCATATCAGGGGTATAGCCCGAAGAAATTCGGATTAACACCGCATAAGATTATAGTTCCGCATGGGACAGTAATTAAATATTTATAGGATATGGATGGGCTCGCGTGACATTAGCTAGTTGGTAGGGTAACGGCTTACCAAGGCTACGATGTCTAGGGGCTCTGAGAGGAGAATCCCCCACACTGGTACTGAGACACGGACCAGACTCATACGGGAGGCAGCAGTAAGGAATATTGGTCAATGGAGGGAACTCTGAACCAGCCATGCCGCGTGCAGGATGACTGCCCTATGGGTTGTAAACTGCTTTTGTCAGGGAATAAACCTTTCTACGTGTAGGAAGCTGAATGTACCTGAAGAATAAGGATCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGATCCGAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGTGCGTAGGCGGCTTATTAAGTCAGGGGTGAAATACGGCAGCTCAACTGTCGCAGTGCCTTTGATACTGATAAGCTTGAATGTGGTTGAAGATGGCGGAATGAGACAAGTAGCGGTGAAATGCATAGATATGTCTCAGAACTCCGATTGCGAAGGCAGCTATCTAAGCCATTATTGACGCTGATGCACGAAAGCGTGGGGATCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGATAACTCGATGTTAGCGATACACAGTTAGCGTCTTAGCGAAAGCGTTAAGTTATCCACCTGGGGAGTACGCCCGCAAGGGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGAGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGATACGCGAGGAACCTTACCCGGGCTTGAAAGTTAGTGAATGATCCAGAGACGGATCAGTCCTTCGGGACACGAAACTAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATGTTTAGTTGCCAGCATGTAATGATGGGGACTCTAAACAGACTGCCTGCGTAAGCAGTGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGTCCGGGGCTACACACGTGCTACAATGGATGGTACAGCGGGCAGCTACACAGCAATGTGATGCCAATCTCGAAAAGCCATTCACAGTTCGGATCGGGGTCTGCAACTCGACCCCGTGAAGTTGGATTCGCTAGTAATCGCGTATCAGCAATGACGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCAAGCCATGAAAGTTGGGGGTGCCTAAAGCATGTAACCGCAAGGAGCGTTCATGGTCAAAACCCCGTC

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tuobaohua

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你进NCBI进行Blast比对啊
https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
2楼2012-03-03 07:51:38
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阿博小硕士

铜虫 (小有名气)

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: Originally posted by tuobaohua at 2012-03-03 07:51:38:
你进NCBI进行Blast比对啊
https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

比对了,但是具体鉴定要看什么同源性,还有很多是非标准菌,所以相似性很低,我就不会了。
3楼2012-03-03 12:58:47
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tuobaohua

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引用回帖:
3楼: Originally posted by 阿博小硕士 at 2012-03-03 12:58:47:
比对了,但是具体鉴定要看什么同源性,还有很多是非标准菌,所以相似性很低,我就不会了。

我只用过16S的
您说这个是全序列,我也不太清楚,不过肯定是可以在Genbank里比对的,具体步骤也不清楚,期待高人进来解决吧
4楼2012-03-03 15:03:15
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