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Anneal 优化结构的问题 已有1人参与
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探讨一个问题,文献中讲到通过MS Focite Anneal得到优化后的构型,但是在Anneal优化的过程中,得到的两个xtd的轨迹文件,一个是name.xtd一个是name anneal.xtd,请问这两个里面分别包含的是那几步过程的轨迹。在选取最优构型时是通过计算比较Hamiltonian大小排序选择,还是通过计算total energy计算选择。 还有一个问题,就是在进行Anneal的过程中Geometry Optimization这个选项勾选上对结果有什么影响,定义中GO过程是对每一步Anneal cycle产生的low energy 进行Minimize然后输出,不知道这种结果和不选择G.O相比较会有什么不同呢,或者说GO过程是如何优化构型的呢? |
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2楼2012-03-02 11:23:07
mutueng
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