24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2281  |  回复: 4

262413748

新虫 (小有名气)

[求助] 高斯画分子式计算优化结构的问题

1.大家怎么画图的?复杂的分子式(270多个原子),通过chemdr-3d-gv里,结果键全乱了,最后自己在view里改了,为什么键会乱?有什么解决方法吗?
2.我自己在view里改过后,计算遇到如下提示,然后终止了。是说分子之间太近造成终止了吗?

  Atom       271         272         273         274         275         276         277         278
IAtWgt=           1           1           1          12           1           1           1          28
AtmWgt=   1.0078250   1.0078250   1.0078250  12.0000000   1.0078250   1.0078250   1.0078250  27.9769284
NucSpn=           1           1           1           0           1           1           1           0
AtZEff=   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000
NQMom=    0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000
NMagM=    2.7928460   2.7928460   2.7928460   0.0000000   2.7928460   2.7928460   2.7928460   0.0000000
AtZNuc=   1.0000000   1.0000000   1.0000000   6.0000000   1.0000000   1.0000000   1.0000000  14.0000000
Leave Link  101 at Mon Apr 14 23:11:46 2014, MaxMem=   536870912 cpu:         4.5
(Enter /public/software/simulation/g09/l202.exe)
Small interatomic distances encountered: 274 212 4.46D-01 Atoms too close. Error termination via Lnk1e in /public/software/simulation/g09/l202.exe at Mon Apr 14 23:11:46 2014.
Job cpu time:       0 days  0 hours  0 minutes  5.2 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      5 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

是,274和212号太近了。
2楼2014-04-16 15:00:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

262413748

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-04-16 15:00:04
是,274和212号太近了。

谢谢你的帮助,我看了下也是。还有个问题想咨询您下,我调整了两个原子位置,再计算优化结构,结果很快算完了,但是本应该是笼状结构的分子被打散了,也就是说化学键断裂,请问是因为我画图时偏差比较大造成的吗?有什么建议解决这个问题吗?谢谢了!!!!
3楼2014-04-16 15:58:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 262413748 at 2014-04-16 15:58:35
谢谢你的帮助,我看了下也是。还有个问题想咨询您下,我调整了两个原子位置,再计算优化结构,结果很快算完了,但是本应该是笼状结构的分子被打散了,也就是说化学键断裂,请问是因为我画图时偏差比较大造成的吗? ...

这种情况,首先你可以看下chk文件里的结构是不是断的,然后你看一下断裂的两个键之间的距离,如果键长数据是合理的话可以认为没问题。
如果不是的话,可能需要调整结构了。
4楼2014-04-17 07:37:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

echoqinglan

木虫 (小有名气)

内容已删除
5楼2017-11-23 13:04:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 262413748 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料工程302分求调剂 +9 zyx上岸! 2026-04-04 9/450 2026-04-05 22:08 by 醉翁wl
[考研] 327求调剂 +4 拾光任染 2026-04-05 4/200 2026-04-05 20:16 by 南航~万老师
[考研] 生物与医药调剂 +4 十七sa 2026-04-05 4/200 2026-04-05 20:05 by lys0704
[考研] 329求调剂 +17 miaodesi 2026-04-02 20/1000 2026-04-05 18:33 by 蓝云思雨
[考研] 求调剂,一志愿郑州大学材料与化工专硕,英二数二342分,求老师收留 +18 v12abo 2026-04-02 20/1000 2026-04-05 11:37 by a8144223
[考研] 359求调剂22408 +3 123456789qw 2026-03-31 3/150 2026-04-05 10:09 by zhq0425
[考研] 材料工程310专硕调剂 +13 捞捞我…. 2026-04-04 14/700 2026-04-05 09:01 by 来看流星雨10
[考研] 0703求调剂383分 +8 W55j 2026-04-03 8/400 2026-04-04 20:09 by xhai2011
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +5 崔wj 2026-03-31 5/250 2026-04-04 19:45 by 1753564080
[考研] 303求调剂 +10 DLkz1314. 2026-03-30 10/500 2026-04-03 18:03 by Jimmyandyou
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +5 崔wj 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:06 by arrow8852
[考研] 求调剂 +9 akdhjs 2026-03-31 11/550 2026-04-03 13:32 by akdhjs
[考研] 319求调剂 +18 太容易1018 2026-04-01 18/900 2026-04-03 11:18 by linyelide
[论文投稿] chinese chemical letters英文版投稿求助 120+4 Yishengeryi 2026-03-30 6/300 2026-04-02 17:19 by Yishengeryi
[考研] 一志愿上海海洋大学083200食品学硕,求调剂,接受其他专业 +6 what张 2026-04-01 7/350 2026-04-02 16:48 by zzsw+
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-04-02 4/200 2026-04-02 13:03 by yulian1987
[考研] 261求B区调剂 +5 明仔· 2026-04-01 7/350 2026-04-02 11:17 by 邹尉尉
[考研] 一志愿浙江大学工科动力工程370,数一121,专业课135,现在能去哪里 +3 080700调剂 2026-03-30 4/200 2026-03-31 12:00 by KLMY666
[考研] 一志愿西电085401数一英一299求调剂 六级521 +4 爱吃大鸭梨 2026-03-31 4/200 2026-03-31 11:51 by 搏击518
[考研] 吉大生物学326分求调剂 +3 sunnyupup 2026-03-31 3/150 2026-03-31 09:28 by longlotian
信息提示
请填处理意见