24小时热门版块排行榜    

查看: 2242  |  回复: 4

262413748

新虫 (小有名气)

[求助] 高斯画分子式计算优化结构的问题

1.大家怎么画图的?复杂的分子式(270多个原子),通过chemdr-3d-gv里,结果键全乱了,最后自己在view里改了,为什么键会乱?有什么解决方法吗?
2.我自己在view里改过后,计算遇到如下提示,然后终止了。是说分子之间太近造成终止了吗?

  Atom       271         272         273         274         275         276         277         278
IAtWgt=           1           1           1          12           1           1           1          28
AtmWgt=   1.0078250   1.0078250   1.0078250  12.0000000   1.0078250   1.0078250   1.0078250  27.9769284
NucSpn=           1           1           1           0           1           1           1           0
AtZEff=   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000
NQMom=    0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000
NMagM=    2.7928460   2.7928460   2.7928460   0.0000000   2.7928460   2.7928460   2.7928460   0.0000000
AtZNuc=   1.0000000   1.0000000   1.0000000   6.0000000   1.0000000   1.0000000   1.0000000  14.0000000
Leave Link  101 at Mon Apr 14 23:11:46 2014, MaxMem=   536870912 cpu:         4.5
(Enter /public/software/simulation/g09/l202.exe)
Small interatomic distances encountered: 274 212 4.46D-01 Atoms too close. Error termination via Lnk1e in /public/software/simulation/g09/l202.exe at Mon Apr 14 23:11:46 2014.
Job cpu time:       0 days  0 hours  0 minutes  5.2 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      5 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

是,274和212号太近了。
2楼2014-04-16 15:00:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

262413748

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-04-16 15:00:04
是,274和212号太近了。

谢谢你的帮助,我看了下也是。还有个问题想咨询您下,我调整了两个原子位置,再计算优化结构,结果很快算完了,但是本应该是笼状结构的分子被打散了,也就是说化学键断裂,请问是因为我画图时偏差比较大造成的吗?有什么建议解决这个问题吗?谢谢了!!!!
3楼2014-04-16 15:58:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 262413748 at 2014-04-16 15:58:35
谢谢你的帮助,我看了下也是。还有个问题想咨询您下,我调整了两个原子位置,再计算优化结构,结果很快算完了,但是本应该是笼状结构的分子被打散了,也就是说化学键断裂,请问是因为我画图时偏差比较大造成的吗? ...

这种情况,首先你可以看下chk文件里的结构是不是断的,然后你看一下断裂的两个键之间的距离,如果键长数据是合理的话可以认为没问题。
如果不是的话,可能需要调整结构了。
4楼2014-04-17 07:37:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

echoqinglan

木虫 (小有名气)

内容已删除
5楼2017-11-23 13:04:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 262413748 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-15 7/350 2026-03-16 09:43 by 闲人终南山
[考研] 材料专硕306英一数二 +3 z1z2z3879 2026-03-16 3/150 2026-03-16 09:19 by Demonsssss
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[考研] 材料工程327求调剂 +3 xiaohe12w 2026-03-11 3/150 2026-03-14 20:20 by ms629
[考研] 265求调剂 +4 威化饼07 2026-03-12 4/200 2026-03-14 17:23 by userper
[考研] 学硕285求调剂 +13 Wisjxn 2026-03-12 46/2300 2026-03-14 10:33 by JourneyLucky
[考研] 332分材料工程调剂 +3 莓好时光海苔 2026-03-09 3/150 2026-03-14 02:03 by JourneyLucky
[考研] 306求调剂 +4 唐薏薏 2026-03-09 4/200 2026-03-14 01:19 by JourneyLucky
[考研] 271求调剂 +10 生如夏花… 2026-03-11 10/500 2026-03-14 00:35 by 卖报员小雨
[考研] 一志愿中科院,化学方向,295求调剂 +4 一氧二氮 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:35 by JourneyLucky
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工085600调剂求老师收留 +9 jiaanl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 20:22 by JourneyLucky
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 293求调剂 +3 世界首富 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:27 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕350 求调剂 +4 王金科 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:02 by ruiyingmiao
[论文投稿] 投稿问题 5+4 星光灿烂xt 2026-03-12 6/300 2026-03-13 14:17 by god_tian
[考研] 08食品或轻工求调剂,本科发表3篇sci一区top论文,一志愿南师大食品科学与工程 +3 我是一个兵, 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:21 by Yuyi.
[考研] 调剂 +5 呵唔哦豁 2026-03-10 5/250 2026-03-10 22:00 by 28375m
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
[考研] 数二英二309分请求调剂 +3 dtdxzxx 2026-03-09 4/200 2026-03-09 19:56 by yuningshan
信息提示
请填处理意见