24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1364  |  回复: 7

rain841230

捐助贵宾 (正式写手)


[交流] 通过Q峰确定H原子坐标的问题

晶体结构基本上已经解出,R1在0.03左右。目前用Q峰确定H原子位置时,可以得到大部分H的合理坐标,还有少部分的H位置不太合理,所以用了DFIX和DANG来限定键长,但是这样一来,其他本来已经确定位置的H坐标又变掉了,精修非常不稳定。有什么方法能够固定原来已经得到正确位置的H的坐标吗?用AFIX命令行不行?具体格式是怎么样的?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sgm060512

木虫 (正式写手)



rain841230(金币+1): 谢谢参与
通常一些常见的氢(苯环,唑类,乙基,甲基等)都通过理论加氢,如果理论加氢出现氢精修不能收敛时,则可通过固定将其固定,格式是
afix 3
atoms
afix 0
另外一种用Q峰加氢,这种情况通常要加限制命令,限制键长和键角,当修到合理位置时,可用上面的固定命令固定,防止氢原子变动,然后进行精修。
希望对楼主有用。
4楼2013-01-25 09:32:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yytsnake

至尊木虫 (职业作家)



rain841230(金币+1): 谢谢参与
HIMP 0.85限制键长。
5楼2013-01-25 10:22:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rain841230(金币+1): 谢谢参与
位置如果不合理,试试用XP加,一个一个来,注意固定
6楼2013-01-25 12:22:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ifent

金虫 (小有名气)



rain841230(金币+1): 谢谢参与
干吗不用afix来加氢呢,dfix是限制性命令,尽量少用。
8楼2013-01-26 20:50:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
2013-01-24 21:40   回复  
rain841230(金币+1): 谢谢参与
祝福
2013-01-24 23:41   回复  
rain841230(金币+1): 谢谢参与
2013-01-26 09:50   回复  
rain841230(金币+1): 谢谢参与
相关版块跳转 我要订阅楼主 rain841230 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 308求调剂 +4 maverick^_^ 2026-04-03 4/200 2026-04-05 19:08 by 蓝云思雨
[考研] 086000生物与医药298调剂求助 +8 元元青青 2026-03-31 10/500 2026-04-05 17:44 by Ecowxq666!
[考研] 一志愿上海海洋大学083200食品学硕,求调剂,接受其他专业083200 +4 what张 2026-04-04 5/250 2026-04-05 14:07 by chw1980_0
[考研] 312求调剂 +3 Say Never 2026-04-04 3/150 2026-04-05 11:19 by guoweigw
[考研] 0703调剂 +11 拾玖壹 2026-04-04 12/600 2026-04-05 10:29 by 果冻大王
[考研] 材料调剂 +11 一样YWY 2026-04-02 13/650 2026-04-04 23:10 by 无际的草原
[考研] 材料科学与工程调剂 +19 深V宿舍吧 2026-03-30 20/1000 2026-04-04 22:13 by hemengdong
[考研] 085600调剂 +4 1amJJ 2026-04-02 4/200 2026-04-04 21:53 by hemengdong
[考研] 333求调剂 +12 wfh030413@ 2026-04-03 13/650 2026-04-04 21:02 by jj987
[考研] 315求调剂 +13 小羊小羊_ 2026-04-02 14/700 2026-04-04 20:30 by 蓝云思雨
[考研] 085600材料与化工调剂 +26 kikiki7 2026-03-30 27/1350 2026-04-04 09:18 by qlm5820
[考研] 266分,求材料相关专业调剂 +13 哇呼哼呼哼 2026-03-30 15/750 2026-04-03 15:24 by arrow8852
[考研] 08工科275分求调剂 +14 AaAa7420 2026-03-31 14/700 2026-04-03 11:13 by cocolv
[考研] 071000生物学调剂 +8 知昭蔓 2026-04-02 8/400 2026-04-03 10:36 by macy2011
[考研] 085600 295分求调剂 +19 W55j 2026-03-30 23/1150 2026-04-03 09:53 by 千千运气
[考研] 085900土木水利336分求调剂 +4 Zhangjiangj 2026-03-31 6/300 2026-04-02 11:40 by 1753564080
[考研] 化学工程专硕324分,一志愿中国矿业大学求调剂 +7 耿耿1314 2026-04-01 7/350 2026-04-02 07:40 by 尚水阁主
[考研] 省双一流重点一本大学招收调剂 +4 wwwwffffff 2026-03-31 7/350 2026-04-01 15:23 by wwwwffffff
[考研] 335求调剂 +3 321* 2026-03-31 4/200 2026-04-01 00:00 by 321*
[考研] 297 地理学070500 复试求调剂 +3 小圆圈圈ooo 2026-03-30 3/150 2026-03-30 21:05 by 余震yz
信息提示
请填处理意见